KEGG   ORTHOLOGY: K03006
Entry
K03006                      KO                                     
Symbol
RPB1, POLR2A
Name
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
map05016  Huntington disease
Disease
H02397  Neurodevelopmental disorder with movement abnormalities or hypotonia
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
 09160 Human Diseases
  09164 Neurodegenerative disease
   05016 Huntington disease
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
   03400 DNA repair and recombination proteins
    K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Core subunits
     K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
DNA repair and recombination proteins [BR:ko03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase II complex
      K03006  RPB1, POLR2A; DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03006
Other DBs
COG: COG0086
GO: 0003899
Genes
HSA: 5430(POLR2A)
PTR: 454463(POLR2A)
PPS: 100978542(POLR2A)
GGO: 101125439(POLR2A)
PON: 100432084(POLR2A)
NLE: 100607400(POLR2A)
MCC: 721865(POLR2A)
MCF: 101866538(POLR2A)
CSAB: 103242561(POLR2A)
CATY: 105582386(POLR2A)
PANU: 100998821(POLR2A)
TGE: 112609382(POLR2A)
RRO: 104661647(POLR2A)
RBB: 108514411(POLR2A)
TFN: 117067775(POLR2A)
PTEH: 111527046(POLR2A) 113222376
CJC: 100389642(POLR2A)
SBQ: 101037169(POLR2A)
CSYR: 103264624(POLR2A)
MMUR: 105877596(POLR2A)
OGA: 100967092(POLR2A)
MMU: 20020(Polr2a)
MCAL: 110304292(Polr2a)
MPAH: 110332723(Polr2a)
RNO: 363633(Polr2a)
MCOC: 116078993(Polr2a)
MUN: 110555136(Polr2a)
CGE: 100689016(Polr2a)
PLEU: 114693182(Polr2a)
NGI: 103752129(Polr2a)
HGL: 101725588(Polr2a)
CPOC: 100734232(Polr2a)
CCAN: 109674720(Polr2a)
DORD: 105983471(Polr2a)
DSP: 122100365(Polr2a)
OCU: 100344349(POLR2A)
OPI: 101531465(POLR2A)
TUP: 102483652(POLR2A)
CFA: 479483(POLR2A)
VVP: 112924841(POLR2A)
VLG: 121500016(POLR2A)
AML: 100466109(POLR2A)
UMR: 103660476(POLR2A)
UAH: 113271138(POLR2A)
UAR: 123792144(POLR2A)
LLV: 125087196
MPUF: 101687537(POLR2A)
ORO: 101366669(POLR2A)
EJU: 114225309(POLR2A)
ZCA: 113908266(POLR2A)
MLX: 118000022(POLR2A)
FCA: 101098500(POLR2A)
PYU: 121015996(POLR2A)
PBG: 122484874(POLR2A)
PTG: 102963688(POLR2A)
PPAD: 109245953(POLR2A)
AJU: 106972432(POLR2A)
HHV: 120231378(POLR2A)
BTA: 282312(POLR2A)
BOM: 102267367(POLR2A)
BIU: 109573647(POLR2A)
BBUB: 102391333(POLR2A)
CHX: 102187892(POLR2A)
OAS: 100144762(POLR2A)
ODA: 120859693 120866050(POLR2A)
CCAD: 122445912(POLR2A)
SSC: 100737040(POLR2A)
CFR: 102521198(POLR2A)
CBAI: 105077503(POLR2A)
CDK: 105103024(POLR2A)
VPC: 102541958(POLR2A)
BACU: 103005752(POLR2A)
LVE: 103085062(POLR2A)
OOR: 101289878(POLR2A)
DLE: 111185756(POLR2A)
PCAD: 102989947(POLR2A) 112063156
PSIU: 116745535(POLR2A)
ECB: 100072997(POLR2A)
EPZ: 103557717(POLR2A)
EAI: 106844204(POLR2A)
MYB: 102240177(POLR2A)
MYD: 102755359(POLR2A)
MMYO: 118672067(POLR2A)
MLF: 102424372(POLR2A)
MNA: 107544585(POLR2A)
PKL: 118727025(POLR2A)
HAI: 109394669(POLR2A)
DRO: 112308505(POLR2A)
SHON: 118974746(POLR2A)
AJM: 119037141(POLR2A)
PDIC: 114515119(POLR2A)
PHAS: 123809261(POLR2A)
MMF: 118633843(POLR2A)
RFQ: 117013079(POLR2A)
PALE: 102885614(POLR2A)
PGIG: 120589664(POLR2A)
PVP: 105291214(POLR2A)
RAY: 107506406(POLR2A)
MJV: 108406494(POLR2A)
TOD: 119230578(POLR2A)
SARA: 101538708(POLR2A)
LAV: 100662030(POLR2A)
TMU: 101354753
DNM: 101422496(POLR2A)
MDO: 100014728(POLR2A)
GAS: 123246316(POLR2A)
SHR: 100926404(POLR2A)
PCW: 110194292(POLR2A)
OAA: 100086954(POLR2A)
PCOC: 116240203(POLR2A)
NMEL: 110391322(POLR2A)
ACYG: 106029400
TGU: 115492686(POLR2A)
LSR: 110480311(POLR2A)
PMOA: 120505359(POLR2A)
OTC: 121340716(POLR2A)
PRUF: 121361037(POLR2A)
GFR: 102043834
FAB: 101819277
PHI: 102114631(POLR2A)
FPG: 101917042(POLR2A)
FCH: 102050838(POLR2A)
ACHC: 115338269(POLR2A)
AAM: 106492922(POLR2A)
AROW: 112962478(POLR2A)
NPD: 112957876(POLR2A)
DNE: 112996334
ASN: 102378270(POLR2A)
AMJ: 102572150(POLR2A)
PSS: 102448760
CPIC: 101934161(POLR2A)
CABI: 116833199
MRV: 120381848(POLR2A)
ACS: 100561860(polr2a)
PVT: 110087752(POLR2A)
SUND: 121933599(POLR2A)
PBI: 103060884(POLR2A)
PMUR: 107295439(POLR2A)
TSR: 106546071(POLR2A)
PGUT: 117660070(POLR2A)
VKO: 123016653(POLR2A)
PMUA: 114581501(POLR2A)
ZVI: 118094350(POLR2A)
GJA: 107119815(POLR2A)
XLA: 108703583(polr2a.S) 108711840(polr2a.L)
XTR: 116409862(polr2a)
NPR: 108803272(POLR2A)
RTEM: 120921682(POLR2A)
BBUF: 120986735(POLR2A)
DRE: 553347(polr2a)
SANH: 107657282(polr2a) 107665858
CCAR: 109056007(polr2a) 109067075
IPU: 108273729(polr2a)
PHYP: 113527336
SMEO: 124389305(polr2a)
AMEX: 103029187(polr2a)
EEE: 113584166(polr2a)
TRU: 101067103(polr2a)
LCO: 104923957(polr2a)
NCC: 104945449(polr2a)
CGOB: 115023473
ELY: 117246100(polr2a)
PLEP: 121961831(polr2a)
SLUC: 116049011(polr2a)
ECRA: 117935249(polr2a)
PFLV: 114545495(polr2a)
GAT: 120822572(polr2a)
PPUG: 119222280(polr2a)
MSAM: 119913294(polr2a)
CUD: 121504102(polr2a)
MZE: 101464637(polr2a)
ONL: 100709712(polr2a) 109195354
OAU: 116330738(polr2a)
OLA: 101160848(polr2a)
OML: 112155889(polr2a)
XMA: 102226500(polr2a)
XCO: 114157914(polr2a)
XHE: 116733018(polr2a)
PRET: 103480466(polr2a)
PFOR: 103137507(polr2a)
PLAI: 106945780(polr2a)
PMEI: 106919136(polr2a)
GAF: 122819954(polr2a)
CVG: 107087766(polr2a)
CTUL: 119783421(polr2a)
GMU: 124880486(polr2a)
NFU: 107377398(polr2a)
KMR: 108249524(polr2a)
ALIM: 106525315(polr2a)
NWH: 119409415(polr2a)
AOCE: 111577181
CSEM: 103387258(polr2a)
POV: 109634842(polr2a)
SSEN: 122765850(polr2a) 122766512
HHIP: 117752032(polr2a)
LCF: 108879972(polr2a)
SDU: 111232989(polr2a)
SLAL: 111665746(polr2a)
XGL: 120797709(polr2a)
HCQ: 109508358(polr2a)
BPEC: 110159458(polr2a)
MALB: 109951387
OMY: 110500684 110531828(polr2a)
ELS: 105020683(polr2a)
SFM: 108923135(polr2a)
PKI: 111854495(polr2a)
AANG: 118223044(polr2a)
LOC: 102682961(polr2a)
LCM: 102363493
RTP: 109921440(polr2a)
BFO: 118427626
BBEL: 109463833
CIN: 100177272
SCLV: 120327714
APLC: 110980806
SKO: 100373197(POLR2A) 102807286
DME: Dmel_CG1554(RpII215)
DER: 6551095
DSE: 6619875
DSI: Dsimw501_GD15986(Dsim_GD15986)
DYA: Dyak_GE17292(Dyak_RpII215)
DAN: 6503074
DSR: 110180408
DPO: Dpse_GA13798(Dpse_RpII215)
DPE: 6599989
DMN: 108158278
DWI: 6648855
DGR: 6569252
DAZ: 108619113
DNV: 108657365
DHE: 111605338
DVI: 6634742
MDE: 101890003
SCAC: 106080855
LCQ: 111675262
ACOZ: 120954743
AARA: 120904770
AAG: 23687783
AALB: 109408106
CPII: 120413130
CNS: 116336729
AME: 550829
ACER: 108003080
ALAB: 122713272
BIM: 100742572
BVK: 117241713
BVAN: 117158284
BTER: 100643011
BPYO: 122573549
CCAL: 108629016
OBB: 114877171
NMEA: 116424521
CGIG: 122395594
SOC: 105203889
MPHA: 105834243
AEC: 105147714
ACEP: 105620252
PBAR: 105426788
VEM: 105565834
HST: 105187653
DQU: 106749029
CFO: 105250715
FEX: 115234152
LHU: 105677199
PGC: 109862221
OBO: 105274537
PCF: 106793100
PFUC: 122516181
VPS: 122628295
NVI: 100116776
CSOL: 105363368
MDL: 103578875
CGLO: 123274439
FAS: 105266800
DAM: 107043002
AGIF: 122855999
CCIN: 107265225
TCA: 662266
DPA: 109540489
ATD: 109605616
CSET: 123306267
LDC: 111518111
NVL: 108562650
APLN: 108743166
PPYR: 116171312
OTU: 111420547
MSEX: 115455995
BANY: 112046901
ZCE: 119829232
HAW: 110375127
OFU: 114349753
PXY: 105389151
BTAB: 109030068
DCI: 103505461
CLEC: 106674451
HHAL: 106681893
NLU: 111048005
ZNE: 110829047
CSEC: 111865626
DMK: 116926715
HAZT: 108665593
DSV: 119441765
RSAN: 119386933
RMP: 119177748
VDE: 111245786
VJA: 111269507
TUT: 107364409
DFR: 124497876
CSCU: 111638839
PTEP: 107442580
SDM: 118205300
CEL: CELE_F36A4.7(ama-1)
CBR: CBG_05355(Cbr-rpb-1)
BMY: BM_BM3864(Bma-ama-1)
TSP: Tsp_05375
PCAN: 112555697
BGT: 106061006
GAE: 121369859
HRJ: 124291224
CRG: 105344236
PMAX: 117341686
MMER: 123554921
OBI: 106878530
OSN: 115215864
EGL: EGR_00038
NVE: 5511617
EPA: 110246041
ATEN: 116295526
ADF: 107336064
AMIL: 114954209
PDAM: 113676307
DGT: 114524717
XEN: 124445891
AQU: 100636102
ATH: AT4G35800(NRPB1)
ALY: 9305132
CRB: 17879200
THJ: 104804281
CPAP: 110822512
CIT: 102617026
MINC: 123198625
TCC: 18610701
DZI: 111300133
VRA: 106777530
VAR: 108321285
VUN: 114173362
CCAJ: 109801014
APRC: 113869989
CAM: 101489580
LJA: Lj2g3v1648020.1(Lj2g3v1648020.1) Lj2g3v1659630.1(Lj2g3v1659630.1)
PPER: 18769771
PMUM: 103340377
PAVI: 110761372
PDUL: 117634445
MNT: 21409262
CSV: 101220606
CMO: 103490666
BHJ: 120091027
MCHA: 111014830
RCU: 8267704
HBR: 110642224
MESC: 110615475
POP: 18099128
PEU: 105124082
PALZ: 118029905
QLO: 115994475
TWL: 120015594
VVI: 100264310
VRI: 117906557
SLY: 778257
SPEN: 107010894
SOT: 102578707(RPB1)
CANN: 107859831
NTA: 107766442 107820355(rpb1)
NSY: 104226138
NTO: 104091054
NAU: 109209258
INI: 109177654
ITR: 115999037
EGT: 105952460
HAN: 110936463
ECAD: 122608140
LSV: 111916783
CCAV: 112511088
DCR: 108222754
BVG: 104897786
SOE: 110793208
NNU: 104604309(RPB1)
DOSA: Os05t0151000-00(Os05g0151000)
OBR: 102715133
BDI: 100841250
ZMA: 541967
PHAI: 112897443
PDA: 103718915
DCT: 110095028
PEQ: 110028132
AOF: 109827408
ATR: 18424189(RPB1)
APRO: F751_1389
SCE: YDL140C(RPO21)
ERC: Ecym_8065
KMX: KLMA_60512(RPB1)
NCS: NCAS_0A13900(NCAS0A13900)
NDI: NDAI_0A02130(NDAI0A02130)
TPF: TPHA_0A03070(TPHA0A03070)
TBL: TBLA_0F02170(TBLA0F02170)
TDL: TDEL_0C02320(TDEL0C02320)
KAF: KAFR_0B01060(KAFR0B01060)
PIC: PICST_75374(RPO21)
CAL: CAALFM_CR10680WA(RPO21)
SLB: AWJ20_3261(RPO21)
BNN: FOA43_002894(RPB1)
BBRX: BRETT_005193(RPB1)
NTE: NEUTE1DRAFT47767(NEUTE1DRAFT_47767) NEUTE1DRAFT70543(NEUTE1DRAFT_70543)
MGR: MGG_04652
SSCK: SPSK_04798
MAW: MAC_07408
MAJ: MAA_00658
CMT: CCM_05485
MBE: MBM_03515
ANI: AN0809.2
ANG: ANI_1_3202014(An01g12710)
ALUC: AKAW2_10348A(RPB1)
ACHE: ACHE_30624A(RPB1)
APUU: APUU_51019A(RPB1)
ABE: ARB_00027
TVE: TRV_02753
PTE: PTT_15561
SPO: SPBC28F2.12(rpb1)
CNE: CNE03720
CNB: CNBE3710
TASA: A1Q1_05094
ABP: AGABI1DRAFT65857(AGABI1DRAFT_65857)
ABV: AGABI2DRAFT215454(AGABI2DRAFT_215454)
MGL: MGL_2782
MRT: MRET_3369
DDI: DDB_G0279193(rpb1)
DFA: DFA_09469(rpb1)
EHI: EHI_121760(147.t00005)
PCB: PCHAS_080730(PC000499.01.0)
TAN: TA03235
TPV: TP03_0185
BBO: BBOV_I003360(19.m02399)
CPV: cgd3_2620
TGO: TGME49_225260(POLR2A)
FCY: FRACYDRAFT_183150(RNA_pol)
TPS: THAPSDRAFT_168(RPB1)
SPAR: SPRG_08025
GTT: GUITHDRAFT_104636(Rpb1)
TCR: 509011.20
LMA: LMJF_31_2610(RPOIILS)
LIF: LINJ_31_2680(RPOIILS)
LPAN: LPMP_312440(RPOIILS)
VG: 10963889(WIV_gp167) 11257036(mg373) 12977914(11R) 14445391(H012_gp622) 1497295(LCDV1gp007) 15766152(PGCG_00263) 16414381(042R) 16512858(pdul_cds_295) 16605586(psal_cds_246) 1733004(IIV6gp172) 18266394(pv_366-368) 18501236(041R) 18501416(044R) 18501593(043R) 18938278(DH26_gp117) 19738704(120R) 20041646(JO84_gp233) 20041750(JO84_gp155) 22220328(NP1450L) 23463173(TW95_gp1522) 25479125(AMQ81_gp076) 25812737(ml_310) 26049265(ceV_398) 26281639(ATL82_gp007) 26683634(AV955_gp089) 28218350(ORF8) 28619867(BGV90_gp007) 2943447(LDVICp190) 2947780(FV3gorf8R) 30523163(BQ3484_210) 30902737(BZK12_gp161) 31050597(B1750_gp011) 3197022(ORF104L) 3654696(EhV064) 3678174(ATVp06) 4156234(MIV090L) 4306175(ORF008) 5076030(HVAV3e_gp011) 5141657(TNAV2c_gp042) 935304(Isaknvgp028) 9887771(crov368) 9925132(R501)
 » show all
Reference
PMID:1542581
  Authors
Wintzerith M, Acker J, Vicaire S, Vigneron M, Kedinger C
  Title
Complete sequence of the human RNA polymerase II largest subunit.
  Journal
Nucleic Acids Res 20:910 (1992)
DOI:10.1093/nar/20.4.910
  Sequence
[hsa:5430]
Reference
PMID:9852112
  Authors
Kershnar E, Wu SY, Chiang CM
  Title
Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes.
  Journal
J Biol Chem 273:34444-53 (1998)
DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
  Sequence
[hsa:5430]

DBGET integrated database retrieval system