KEGG   ORTHOLOGY: K12875
Entry
K12875                      KO                                     

Name
ACIN1, ACINUS
Definition
apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
   03041 Spliceosome
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Other DBs
TC: 3.A.18.1
Genes
HSA: 22985(ACIN1)
PTR: 452792(ACIN1)
PPS: 100982806(ACIN1)
GGO: 101130589(ACIN1)
PON: 100441233(ACIN1)
NLE: 100594211(ACIN1)
MCC: 713310(ACIN1)
MCF: 102140949(ACIN1)
CSAB: 103231461(ACIN1)
RRO: 104674147(ACIN1)
RBB: 108523549(ACIN1)
CJC: 100395500(ACIN1)
SBQ: 101035336(ACIN1)
MMU: 56215(Acin1)
MCAL: 110309502(Acin1)
MPAH: 110325592(Acin1)
RNO: 305884(Acin1)
MUN: 110550035(Acin1)
CGE: 100769875(Acin1)
NGI: 103739470(Acin1)
HGL: 101718648(Acin1)
CCAN: 109685665(Acin1)
OCU: 100338262(ACIN1)
TUP: 102476145(ACIN1)
CFA: 480247(ACIN1)
VVP: 112926505(ACIN1)
AML: 100470890(ACIN1)
UMR: 103681036(ACIN1)
UAH: 113246017(ACIN1)
ORO: 101365802(ACIN1)
ELK: 111140671
FCA: 101092859(ACIN1)
PTG: 102967669(ACIN1)
PPAD: 109255034(ACIN1)
AJU: 106988222(ACIN1)
BTA: 534600(ACIN1)
BOM: 102277013(ACIN1)
BIU: 109564806(ACIN1)
BBUB: 102403177(ACIN1)
CHX: 102182699(ACIN1)
OAS: 101122696(ACIN1)
SSC: 100156353(ACIN1)
CFR: 102516665(ACIN1)
CDK: 105096982(ACIN1) 116153486
BACU: 103008173(ACIN1)
LVE: 103086038(ACIN1)
OOR: 101280956(ACIN1)
DLE: 111164099(ACIN1)
PCAD: 102980214(ACIN1)
ECB: 100055865(ACIN1)
EPZ: 103556737(ACIN1)
EAI: 106840647(ACIN1)
MYB: 102254655(ACIN1)
MYD: 102752916(ACIN1)
HAI: 109393669
DRO: 112301436(ACIN1)
PALE: 102883827
RAY: 107497999(ACIN1)
MJV: 108400011(ACIN1)
LAV: 100673527(ACIN1)
TMU: 101343564
SHR: 100933439(ACIN1)
PCW: 110192412(ACIN1)
OAA: 103165410(ACIN1)
PHI: 106628920
ASN: 102381515(ACIN1)
AMJ: 102574582(ACIN1)
CMY: 102930650(ACIN1)
CPIC: 101933498(ACIN1)
ACS: 100554591(acin1)
PVT: 110087816(ACIN1)
PBI: 103062346(ACIN1)
PMUR: 107294114(ACIN1)
TSR: 106556311(ACIN1) 106556591
PMUA: 114582334(ACIN1)
GJA: 107106145(ACIN1)
XLA: 733423 734979(acin1.S)
XTR: 407918(acin1)
NPR: 108786742 108786764(ACIN1)
DRE: 327495(acin1b) 368893(acin1a)
IPU: 108267949
PHYP: 113539899(acin1)
EEE: 113578280 113589191(acin1)
MZE: 101464651 101466250(acin1)
OLA: 101170959 111949076(acin1)
PRET: 103475989 103478881(acin1)
CVG: 107087714(acin1) 107102485
NFU: 107377177 107384246(acin1)
CSEM: 103388267 103396595(acin1)
POV: 109640428(acin1) 109643374
HCQ: 109508424 109512778(acin1)
PKI: 111837706 111854537(acin1)
LCM: 102353532(ACIN1)
CIN: 100185590
SPU: 591423
APLC: 110983264
SKO: 100372356
DME: Dmel_CG10473(Acn)
DER: 6549440
DSE: 6614635
DSI: Dsimw501_GD24176(Dsim_GD24176)
DSR: 110183737
DPE: 6589552
DMN: 108163460
DWI: 6643845
DAZ: 108611781
DNV: 115563588
DHE: 111598987
DVI: 6628463
MDE: 101894106
LCQ: 111681727
AAG: 5579234
AME: 100578161
BIM: 100740403
BTER: 100644957
CCAL: 108628603
OBB: 114880954
SOC: 105199270
MPHA: 105835474
AEC: 105152705
ACEP: 105620932
PBAR: 105427891
VEM: 105568296
HST: 105181064
DQU: 106749856
CFO: 105252039
LHU: 105670549
PGC: 109852412
OBO: 105285915
PCF: 106785299
NVI: 100122901
CSOL: 105368702
MDL: 103570963
TCA: 658123
DPA: 109535739
ATD: 109599541
NVL: 108563869
API: 100164637
DNX: 107162198
AGS: 114132525
RMD: 113549306
BTAB: 109030858
CLEC: 106668805
ZNE: 110830054
FCD: 110860275
TUT: 107367326
DPTE: 113789246
CSCU: 111630578
PTEP: 107451679
CEL: CELE_C43E11.1(acin-1)
CBR: CBG12098(Cbr-cogc-5)
BMY: Bm1_19495
TSP: Tsp_09565
PCAN: 112553409
CRG: 105337759
MYI: 110443247
OBI: 106877945
LAK: 106169195
NVE: 116618186
EPA: 110253029
AMIL: 114962102
PDAM: 113667055
SPIS: 111335229
DGT: 114516401
HMG: 100198519
AQU: 100641335
ATH: AT4G39680
ALY: 9302950
CRB: 17878061
RSZ: 108822503
CPAP: 110826427
CIT: 102612499
TCC: 18611632
EGR: 104418232
VRA: 106756229
VAR: 108329179
VUN: 114175829
CCAJ: 109789528
CAM: 101502466
LJA: Lj0g3v0230509.1(Lj0g3v0230509.1) Lj0g3v0230509.2(Lj0g3v0230509.2) Lj0g3v0230509.3(Lj0g3v0230509.3) Lj4g3v2802780.1(Lj4g3v2802780.1)
FVE: 101301983
RCN: 112185849
PPER: 18775354
PMUM: 103343246
PAVI: 110773611
PXB: 103934089
ZJU: 107425402
CMO: 103494402
MCHA: 111008217
RCU: 8265619
JCU: 105627963
QSU: 112023653
SLY: 101245055
SPEN: 107017631
SIND: 105176487
BVG: 104895719
SOE: 110786143
DOSA: Os07t0626200-01(Os07g0626200)
ATS: 109756890(LOC109756890) 109781791(LOC109781791)
SBI: 110431408
DCT: 110110510
PEQ: 110033210
AOF: 109832652
DFA: DFA_07562
 » show all
Reference
  Authors
Sahara S, Aoto M, Eguchi Y, Imamoto N, Yoneda Y, Tsujimoto Y
  Title
Acinus is a caspase-3-activated protein required for apoptotic chromatin condensation.
  Journal
Nature 401:168-73 (1999)
DOI:10.1038/43678
  Sequence
[hsa:22985]
Reference
  Authors
Tange TO, Shibuya T, Jurica MS, Moore MJ
  Title
Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core.
  Journal
RNA 11:1869-83 (2005)
DOI:10.1261/rna.2155905
  Sequence
[hsa:22985]

DBGET integrated database retrieval system