KEGG   ORTHOLOGY: K12875
Entry
K12875                      KO                                     

Name
ACIN1, ACINUS
Definition
apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Pathway
ko03013  RNA transport
ko03015  mRNA surveillance pathway
ko03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
  09122 Translation
   03013 RNA transport
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
   03015 mRNA surveillance pathway
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
   03041 Spliceosome
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    EJC complex
     K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Spliceosome [BR:ko03041]
 Complex C
  Other components
   EJC/TREX
    K12875  ACIN1, ACINUS; apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus
Other DBs
TC: 3.A.18.1
Genes
HSA: 22985(ACIN1)
PTR: 452792(ACIN1)
PPS: 100982806(ACIN1)
GGO: 101130589(ACIN1)
PON: 100441233(ACIN1)
NLE: 100594211(ACIN1)
MCC: 713310(ACIN1)
MCF: 102140949(ACIN1)
CSAB: 103231461(ACIN1)
RRO: 104674147(ACIN1)
RBB: 108523549(ACIN1)
CJC: 100395500(ACIN1)
SBQ: 101035336(ACIN1)
MMU: 56215(Acin1)
MCAL: 110309502(Acin1)
MPAH: 110325592(Acin1)
RNO: 305884(Acin1)
MUN: 110550035(Acin1)
CGE: 100769875(Acin1)
NGI: 103739470(Acin1)
HGL: 101718648(Acin1)
CCAN: 109685665(Acin1)
OCU: 100338262(ACIN1)
TUP: 102476145(ACIN1)
CFA: 480247(ACIN1)
VVP: 112926505(ACIN1)
AML: 100470890(ACIN1)
UMR: 103681036(ACIN1)
UAH: 113246017(ACIN1)
ORO: 101365802(ACIN1)
ELK: 111140671
FCA: 101092859(ACIN1)
PTG: 102967669(ACIN1)
PPAD: 109255034(ACIN1)
AJU: 106988222(ACIN1)
BTA: 534600(ACIN1)
BOM: 102277013(ACIN1)
BIU: 109564806(ACIN1)
BBUB: 102403177(ACIN1)
CHX: 102182699(ACIN1)
OAS: 101122696(ACIN1)
SSC: 100156353(ACIN1)
CFR: 102516665(ACIN1)
CDK: 105096982(ACIN1) 116153486
BACU: 103008173(ACIN1)
LVE: 103086038(ACIN1)
OOR: 101280956(ACIN1)
DLE: 111164099(ACIN1)
PCAD: 102980214(ACIN1)
ECB: 100055865(ACIN1)
EPZ: 103556737(ACIN1)
EAI: 106840647(ACIN1)
MYB: 102254655(ACIN1)
MYD: 102752916(ACIN1)
MNA: 107531656 107531699
HAI: 109393669
DRO: 112301436(ACIN1)
PALE: 102883827
RAY: 107497999(ACIN1)
MJV: 108400011(ACIN1)
LAV: 100673527(ACIN1)
TMU: 101343564
MDO: 100030457 103092024
SHR: 100933439(ACIN1)
PCW: 110192412(ACIN1)
OAA: 103165410(ACIN1)
PHI: 106628920
ASN: 102381515(ACIN1)
AMJ: 102574582(ACIN1)
CMY: 102930650(ACIN1)
CPIC: 101933498(ACIN1)
ACS: 100554591(acin1)
PVT: 110087816(ACIN1)
PBI: 103062346(ACIN1)
PMUR: 107294114(ACIN1)
TSR: 106556311(ACIN1) 106556591
PMUA: 114582334(ACIN1)
GJA: 107106145(ACIN1)
XLA: 733423 734979(acin1.S)
XTR: 407918(acin1)
NPR: 108786742 108786764(ACIN1)
DRE: 327495(acin1b) 368893(acin1a)
SRX: 107706346 107738206 107742278 107753932
SANH: 107668844 107668955 107691940 107694674
SGH: 107557984 107562517 107588150 107591382
CCAR: 109064681 109064682 109075854 109112277
IPU: 108267949
PHYP: 113539899(acin1)
AMEX: 103024124 103041520
EEE: 113578280 113589191(acin1)
TRU: 101061384 101074005
TNG: GSTEN00015141G001 GSTEN00025881G001
LCO: 104927977 104932906
NCC: 104943187 104949277 104956584(acin1)
MZE: 101464651 101466250(acin1)
ONL: 100712586 106097156
OLA: 101170959 111949076(acin1)
XMA: 102217545 102237119
XCO: 114146494 114156802
PRET: 103475989 103478881(acin1)
CVG: 107087714(acin1) 107102485
NFU: 107377177 107384246(acin1)
KMR: 108238627 108245921
ALIM: 106514892(acin1) 106517891 106526430 106535998
AOCE: 111567476 111577976
CSEM: 103388267 103396595(acin1)
POV: 109640428(acin1) 109643374
LCF: 108883933 108903047
SDU: 111223791 111235663
SLAL: 111647202 111666578
HCQ: 109508424 109512778(acin1)
BPEC: 110170375(acin1) 110171990 110172043
MALB: 109962613 109974410
SASA: 106569440(acin1) 106577794 106600278 106608850
OTW: 112214863 112226706 112235593 112259628 112260765
SALP: 111953219 111956624 111979289 112069116
ELS: 105020563 105021555(acin1) 114830399
SFM: 108930936 108937851(acin1) 114911832
PKI: 111837706 111854537(acin1)
LCM: 102353532(ACIN1)
BFO: BRAFLDRAFT_238317
CIN: 100185590
SPU: 591423
APLC: 110983264
SKO: 100372356
DME: Dmel_CG10473(Acn)
DER: 6549440
DSE: 6614635
DSI: Dsimw501_GD24176(Dsim_GD24176)
DYA: Dyak_GE13225
DSR: 110183737
DPO: Dpse_GA10336
DPE: 6589552
DMN: 108163460
DWI: 6643845
DGR: Dgri_GH10892
DMO: Dmoj_GI13075
DAZ: 108611781
DNV: 115563588
DHE: 111598987
DVI: 6628463
MDE: 101894106
LCQ: 111681727
AGA: AgaP_AGAP009237
AAG: 5579234
AALB: 109404786 109423912
CQU: CpipJ_CPIJ004841
AME: 100578161
BIM: 100740403
BTER: 100644957
CCAL: 108628603
OBB: 114880954
SOC: 105199270
MPHA: 105835474
AEC: 105152705
ACEP: 105620932
PBAR: 105427891
VEM: 105568296
HST: 105181064
DQU: 106749856
CFO: 105252039
LHU: 105670549
PGC: 109852412
OBO: 105285915
PCF: 106785299
NVI: 100122901
CSOL: 105368702
MDL: 103570963
TCA: 658123
DPA: 109535739
ATD: 109599541
NVL: 108563869
DPL: KGM_214130
API: 100164637
DNX: 107162198
AGS: 114132525
RMD: 113549306
BTAB: 109030858
CLEC: 106668805
PHU: Phum_PHUM463890
ZNE: 110830054
FCD: 110860275
DPX: DAPPUDRAFT_259237
ISC: IscW_ISCW004423
TUT: 107367326
DPTE: 113789246
CSCU: 111630578
PTEP: 107451679
CEL: CELE_C43E11.1(acin-1)
CBR: CBG12098(Cbr-cogc-5)
BMY: Bm1_19495
LOA: LOAG_02896
NAI: NECAME_01311
TSP: Tsp_09565
HRO: HELRODRAFT_182973
PCAN: 112553409
CRG: 105337759
MYI: 110443247
OBI: 106877945
LAK: 106169195
SMM: Smp_039490.1
OVI: T265_04671
NVE: 116618186
EPA: 110253029
AMIL: 114962102
PDAM: 113667055
SPIS: 111335229
DGT: 114516401
HMG: 100198519
TAD: TRIADDRAFT_55789
AQU: 100641335
ATH: AT4G39680
ALY: 9302950
CRB: 17878061
CSAT: 104716251 104720899 104729289
EUS: EUTSA_v10024660mg
BRP: 103835104 103851344
BNA: 106361360 106363140 106390420 106439157
BOE: 106332671 106335122
RSZ: 108822503
THJ: 104807709 104824862
CPAP: 110826427
CIT: 102612499
CIC: CICLE_v10025009mg
TCC: 18611632
GRA: 105763681 105784983 105784984 105787854
GHI: 107906954 107941967 107950385 107950386 107951672
GAB: 108466554 108466555 108478007
DZI: 111291891 111299836 111316944
EGR: 104418232
GMX: 100786288 100816245
GSJ: 114382681 114397730
PVU: PHAVU_001G250000g
VRA: 106756229
VAR: 108329179
VUN: 114175829
CCAJ: 109789528
MTR: MTR_3g087830 MTR_8g091530
CAM: 101502466
LJA: Lj0g3v0230509.1(Lj0g3v0230509.1) Lj0g3v0230509.2(Lj0g3v0230509.2) Lj0g3v0230509.3(Lj0g3v0230509.3) Lj4g3v2802780.1(Lj4g3v2802780.1)
ADU: 107469237 107480405
AIP: 107622560 107631117
LANG: 109328401 109343649 109343650
FVE: 101301983
RCN: 112185849
PPER: 18775354
PMUM: 103343246
PAVI: 110773611
MDM: 103401693 103437612
PXB: 103934089
ZJU: 107425402
CSV: 101213308 116406242
CMO: 103494402
MCHA: 111008217
CMAX: 111479026 111483034
CMOS: 111435887 111447305
CPEP: 111794288 111809860
RCU: 8265619
JCU: 105627963
HBR: 110671011 110671012
MESC: 110629388 110630280
POP: 7456930 7477106
PEU: 105111866 105123838 105136072
JRE: 109010171 109013259
QSU: 112023653
VVI: 100248897 100252593
SLY: 101245055
SPEN: 107017631
SOT: 102581657 102582659
CANN: 107867564 107867565
NTA: 107780879 107787584 107807454 107825767
NSY: 104222647 104239460
NTO: 104098804 104098806
NAU: 109243407 109243408
INI: 109149513 109185733
SIND: 105176487
OEU: 111386794 111408895 111409077
HAN: 110903685 110910921 110912098
LSV: 111882882 111906474
CCAV: 112515431 112515879
DCR: 108204286 108214537
BVG: 104895719
SOE: 110786143
CQI: 110682172 110718182
NNU: 104600068 104605908
PSOM: 113281762 113281774 113286927 113290482 113331838 113347478
OSA: 4332988 4343967
DOSA: Os07t0626200-01(Os07g0626200)
OBR: 102705892 102719029
BDI: 100828438 100830765
ATS: 109756890(LOC109756890) 109781791(LOC109781791)
SBI: 110431408
ZMA: 100381870 100502129 103635858
SITA: 101756757 101758731
PDA: 103700797 103713319
EGU: 105041650 105048600
MUS: 103976716 103979203
DCT: 110110510
PEQ: 110033210
AOF: 109832652
ATR: 18422129 18427065 18436757
SMO: SELMODRAFT_442865 SELMODRAFT_444007
PPP: 112286216 112292409
VCN: VOLCADRAFT_98786
CSL: COCSUDRAFT_65753
CVR: CHLNCDRAFT_56500
MLR: MELLADRAFT_64750
MBR: MONBRDRAFT_31107
SRE: PTSG_04833
DFA: DFA_07562
 » show all
Reference
  Authors
Sahara S, Aoto M, Eguchi Y, Imamoto N, Yoneda Y, Tsujimoto Y
  Title
Acinus is a caspase-3-activated protein required for apoptotic chromatin condensation.
  Journal
Nature 401:168-73 (1999)
DOI:10.1038/43678
  Sequence
[hsa:22985]
Reference
  Authors
Tange TO, Shibuya T, Jurica MS, Moore MJ
  Title
Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core.
  Journal
RNA 11:1869-83 (2005)
DOI:10.1261/rna.2155905
  Sequence
[hsa:22985]

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (3)   
   TC (1)   
Pathway (6)   
   KEGG PATHWAY (6)   
Gene (2000)   
   KEGG GENES (452)   
   KEGG MGENES (119)   
   RefGene (1414)   
   OC (15)   
Protein sequence (155)   
   UniProt (153)   
   SWISS-PROT (2)   
Literature (2)   
   PubMed (2)   
All databases (2167)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system