KEGG   ENZYME: 6.3.2.4Help
Entry
EC 6.3.2.4                  Enzyme                                 

Name
D-alanine---D-alanine ligase;
MurE synthetase [ambiguous];
alanine:alanine ligase (ADP-forming);
alanylalanine synthetase
Class
Ligases;
Forming carbon-nitrogen bonds;
Acid-D-amino-acid ligases (peptide synthases)
BRITE hierarchy
Sysname
D-alanine:D-alanine ligase (ADP-forming)
Reaction(IUBMB)
ATP + 2 D-alanine = ADP + phosphate + D-alanyl-D-alanine [RN:R01150]
Reaction(KEGG)
Substrate
ATP [CPD:C00002];
D-alanine [CPD:C00133]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009];
D-alanyl-D-alanine [CPD:C00993]
Comment
Involved with EC 6.3.2.7 (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate---L-lysine ligase) or EC 6.3.2.13 (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate---2,6-diaminopimelate ligase), EC 6.3.2.8 (UDP-N-acetylmuramate---L-alanine ligase), EC 6.3.2.9 (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine---D-glutamate ligase) and EC 6.3.2.10 (UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide---D-alanyl-D-alanine ligase) in the synthesis of a cell-wall peptide (click here for diagram).
History
EC 6.3.2.4 created 1961, modified 2002
Pathway
ec00473  D-Alanine metabolism
ec00550  Peptidoglycan biosynthesis
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K01921  D-alanine-D-alanine ligase
Genes
ECO: b0092(ddlB) b0381(ddlA)
ECJ: JW0090(ddlB) JW0372(ddlA)
ECD: ECDH10B_0074(ddlB) ECDH10B_0338(ddlA)
EBW: BWG_0087(ddlB) BWG_0265(ddlA)
ECOK: ECMDS42_0085(ddlB) ECMDS42_0281(ddlA)
ECE: Z0102(ddlB) Z0477
ECS: ECs0096(ddl) ECs0431(ddl)
ECF: ECH74115_0100(ddlB) ECH74115_0453(ddlA)
ETW: ECSP_0095(ddlB) ECSP_0441(ddlA)
ELX: CDCO157_0095(ddl) CDCO157_0419(ddl)
EOJ: ECO26_0095(ddlB) ECO26_0414(ddlA)
EOI: ECO111_0095(ddlB) ECO111_0411(ddlA)
EOH: ECO103_0094(ddlB) ECO103_0356(ddlA)
ECOO: ECRM13514_0096(ddl) ECRM13514_0469(ddl_2)
ECOH: ECRM13516_0099(ddl) ECRM13516_0359(ddl_2)
ECG: E2348C_0097(ddlB) E2348C_0317(ddlA)
EOK: G2583_0096(ddlB) G2583_0489(ddlA)
ESO: O3O_04290(ddl) O3O_05690(ddl)
ESM: O3M_19590(ddl) O3M_20995(ddl)
ESL: O3K_19605(ddl) O3K_21095(ddl)
ECW: EcE24377A_0094(ddlB) EcE24377A_0406(ddlA)
ECC: c0110(ddlB) c0487(ddlA)
ECI: UTI89_C0101(ddlB) UTI89_C0398(ddlA)
ECV: APECO1_1627(ddlA) APECO1_1894(ddlB)
ECX: EcHS_A0098(ddlB) EcHS_A0447(ddlA)
ECM: EcSMS35_0097(ddlB) EcSMS35_0410(ddlA)
ECR: ECIAI1_0091(ddlB) ECIAI1_0377(ddlA)
ECQ: ECED1_0093(ddlB) ECED1_0404(ddlA)
ECK: EC55989_0088(ddlB) EC55989_0386(ddlA)
ECT: ECIAI39_0095(ddl) ECIAI39_0301(ddl)
EOC: CE10_0094(ddlB) CE10_0343(ddlA)
EUM: ECUMN_0092(ddlB) ECUMN_0418(ddlA)
ECZ: ECS88_0095(ddlB) ECS88_0375(ddlA)
ELO: EC042_0093(ddlB) EC042_0413(ddlA)
ELN: NRG857_00470(ddl1) NRG857_01775(ddl2)
EBR: ECB_00093(ddlB) ECB_00328(ddlA)
EKF: KO11_00445(ddlB) KO11_21710(ddlA)
EAB: ECABU_c00970(ddlB) ECABU_c04590(ddlA)
EIH: ECOK1_0093(ddlB) ECOK1_0359(ddlA)
ELU: UM146_15470(ddl) UM146_23245(ddl)
ELW: ECW_m0091(ddlB) ECW_m0451(ddlA)
ELL: WFL_00445(ddlB) WFL_02225(ddlA)
ELC: i14_0101(ddl) i14_0469(ddl)
ELD: i02_0101(ddl) i02_0469(ddl)
ELP: P12B_c0084(ddlB) P12B_c0397(ddlA)
EBL: ECD_00093(ddlB) ECD_00328(ddlA)
EBE: B21_00092(ddlB) B21_00332(ddlA)
ELF: LF82_0455(ddlA) LF82_0456(ddlB)
ECOL: LY180_00450(ddl)
ECOI: ECOPMV1_00095(ddlB) ECOPMV1_00368(ddlA)
ECOS: EC958_0232(ddlB) EC958_0517(ddlA)
EFE: EFER_0114(ddlB) EFER_2642(ddlA)
STY: STY0150(ddlB) STY0412(ddlA)
STT: t0134(ddlB) t2484(ddlA)
SENT: TY21A_00690(ddl) TY21A_12615(ddl)
STM: STM0130(ddlB) STM0380(ddlA)
SEO: STM14_0156(ddl_2) STM14_0448(ddl_1)
SEY: SL1344_0130(ddlB) SL1344_0375(ddlA)
SEM: STMDT12_C01300(ddlB) STMDT12_C04420(ddlA)
SEJ: STMUK_0132(ddl) STMUK_0386(ddl)
SEB: STM474_0136(ddl) STM474_0395(ddl)
SEF: UMN798_0143(ddl) UMN798_0417(ddlA)
SETU: STU288_00650(ddl) STU288_12490(ddl)
SENR: STMDT2_01321(ddl) STMDT2_03761(ddlA)
SEND: DT104_01351(ddl) DT104_04241(ddlA)
SPT: SPA0132(ddlB)
SEK: SSPA0128
SEI: SPC_0139(ddl) SPC_0390(ddl)
SEC: SCH_0127(ddlB) SCH_0421(ddlA)
SEG: SG0131(ddlB) SG0392(ddlA)
SEL: SPUL_2592(ddlA)
SEGA: SPUCDC_2578(ddlA)
SET: SEN0131(ddlB) SEN0363(ddlA)
SEEP: I137_11785
SENB: BN855_1360(ddlB) BN855_3730(ddlA)
SENE: IA1_00655(ddl) IA1_02040
SBG: SBG_0119(ddlB) SBG_0336(ddlA)
SFL: SF0089(ddl) SF0232(ddl)
SFX: S0091(ddlB) S0254(ddlA)
SFV: SFV_0085(ddlB) SFV_0344(ddlA)
SFE: SFxv_0093(ddlB) SFxv_0245(ddlA)
SFT: NCTC1_00090(ddl_1) NCTC1_00243(ddl_2)
SSN: SSON_0100(ddlB) SSON_0356(ddlA)
SBO: SBO_0080(ddlB) SBO_0276(ddlA)
SBC: SbBS512_E0085(ddlB) SbBS512_E0298(ddlA)
SDY: SDY_0122(ddl) SDY_0365(ddl)
ENO: ECENHK_03860(ddl) ECENHK_04855(ddl)
ECLO: ENC_46040
EEC: EcWSU1_00705(ddlB) EcWSU1_00897(ddlA)
ENL: A3UG_03685(ddl) A3UG_04800(ddl)
CSK: ES15_3006(ddl) ES15_3230
CTU: CTU_07250(ddlB) CTU_09540(ddlA)
KPN: KPN_00096(ddl) KPN_00323(ddl)
KPU: KP1_0914(ddl) KP1_1182(ddl)
KPE: KPK_4364(ddlA) KPK_4645(ddlB)
KPO: KPN2242_02915(ddl)
KPR: KPR_1024(ddl) KPR_4402(ddlA)
KPX: PMK1_02404(ddlB) PMK1_02651(ddlA)
KPNK: BN49_1297(ddlA) BN49_4244(ddl)
KOX: KOX_10935(ddl) KOX_12350
KOY: J415_25255(ddl) J415_26780(ddl)
EAE: EAE_11270(ddl) EAE_12355
CRO: ROD_00981(ddlB) ROD_04231(ddlA)
BFL: Bfl474(ddlA)
BPN: BPEN_490(ddlA)
BVA: BVAF_475(ddl)
BCHR: BCHRO640_504(ddlA)
BEN: BOBLI757_479(ddlA)
BED: BTURN675_468(ddlA)
HDE: HDEF_1781(ddlB)
SECT: A359_02510
SEHC: A35E_00476
EBT: EBL_c29420(ddlA) EBL_c32640(ddlB)
ROR: RORB6_13625(ddl) RORB6_14760(ddl)
ICP: ICMP_393(ddlB)
LPV: HYN51_05630(ddl)
SBW: TGUWTKB_2300(ddlA)
DEN: MHIR_DE00264(ddlA)
YPE: YPO0557(ddl)
YPK: y3624(ddlB)
YPH: YPC_4069(ddlB)
YPA: YPA_3544
YPN: YPN_0423
YPM: YP_3627(ddlB)
YPZ: YPZ3_0535(ddl)
YPT: A1122_02295(ddl)
YPD: YPD4_0487(ddl)
YPX: YPD8_0489(ddl)
YPW: CH59_1307
YPJ: CH55_2294
YPV: BZ15_3017
YPL: CH46_360
YPS: YPTB0690(ddlB)
YPO: BZ17_1865
YPY: YPK_3516
YPB: YPTS_0717
YPQ: DJ40_1680(ddlB)
YPU: BZ21_4074
YPR: BZ20_1406
YPC: BZ23_167
YPF: BZ19_42
YEN: YE0674(ddl) YE3211(ddlA)
YEW: CH47_2580(ddlA) CH47_2807(ddlB)
YEE: YE5303_26661(ddlB) YE5303_36691(ddlA)
YSI: BF17_11740(ddl)
YAL: AT01_1521 AT01_3201(ddlB)
YFR: AW19_2193(ddlA) AW19_4013(ddlB)
YRU: BD65_2558(ddlB) BD65_600
YAK: ACZ76_12480(ddl)
YMA: DA391_18645(ddl)
SRL: SOD_c06290(ddl) SOD_c12510(ddlA)
SPLY: Q5A_003310(ddl_1) Q5A_006870(ddlA)
SSZ: SCc_139(ddlB)
SMW: SMWW4_v1c07490(ddlB) SMWW4_v1c13450(ddlA)
SMAR: SM39_0077(ddlB) SM39_0796(ddlA)
SMAC: SMDB11_0077(ddlB) SMDB11_0625(ddlA)
SFO: Z042_26455(ddl)
RAA: Q7S_15455 Q7S_18990(ddl)
ECA: ECA3813(ddlB)
PATR: EV46_18695(ddl)
PATO: GZ59_38090(ddlB)
PCT: PC1_3590
PCV: BCS7_17985(ddl)
PPAR: A8F97_22615(ddl)
PEC: W5S_3918
PWS: A7983_03910(ddl)
PPOA: BJK05_12985(ddl)
SGL: SG0899
SOD: Sant_1380(ddl) Sant_2741(ddl2)
PES: SOPEG_0490(ddl)
SENY: HBA_0388(ddlA)
DDD: Dda3937_01186(ddlA)
DDQ: DDI_0574
BGJ: AWC36_22825(ddl)
ETA: ETA_07570(ddl)
EPY: EpC_07450(ddl)
EPR: EPYR_00788(ddlB)
EAM: EAMY_2887(ddlB)
EAY: EAM_0700(ddlB)
EBI: EbC_07220(ddl)
ERJ: EJP617_03490(ddl)
EGE: EM595_0726(ddlB)
EPE: CI789_14880(ddl)
BAK: BAKON_215(ddl)
BUH: BUAMB_197(ddl)
BAPF: BUMPF009_CDS00380(ddlb)
BAPG: BUMPG002_CDS00381(ddlb)
BAPU: BUMPUSDA_CDS00380(ddlb)
BAPW: BUMPW106_CDS00381(ddlb)
BAS: BUsg_208(ddlB)
BAB: bbp_196(ddlB)
BAPH: IX46_01120(ddl)
WBR: ddlA
WGL: WIGMOR_0569(ddlA)
PAM: PANA_0721(ddlB) PANA_3442(ddlA)
PLF: PANA5342_0611(ddlA) PANA5342_3589(ddlB)
PAJ: PAJ_0068(ddlB) PAJ_2675(ddlA)
PVA: Pvag_0123(ddlB) Pvag_2711(ddlA)
PANP: PSNIH2_14435(ddl)
HHS: HHS_02990
PSTW: DSJ_06255(ddl) DSJ_20720
PALH: B1H58_03515(ddl)
PGZ: C2E15_04330(ddl)
PCD: C2E16_04255(ddl)
TPTY: NCTC11468_03214(ddlA)
PLU: plu3652(ddl)
PLUM: A4R40_18135(ddl)
PAY: PAU_01115(ddlB)
PTT: VY86_14940(ddl)
PMR: PMI1243(ddlA)
PMIB: BB2000_1263(ddlA)
XBO: XBJ1_3474(ddlB)
XBV: XBW1_3909(ddl)
XNE: XNC1_1059(ddlB)
XNM: XNC2_1042(ddlB)
XDO: XDD1_3016(ddl)
XPO: XPG1_0682(ddl)
XHO: A9255_11140(ddl)
PSI: S70_03855(ddl) S70_20780
PSX: DR96_3056(ddlA) DR96_3930(ddlB)
PRG: RB151_022050(ddlA) RB151_030430(ddl)
PHEI: NCTC12003_01248(ddlB) NCTC12003_02086(ddlA)
MMK: MU9_3056
ASY: AUT07_00550(ddl)
ETR: ETAE_0639(ddl) ETAE_3371
ETE: ETEE_1602(ddl) ETEE_2406(ddl)
ETC: ETAC_03095(ddl) ETAC_16085(ddl)
HAV: AT03_18180(ddl)
HPAR: AL518_08495(ddl)
OPO: DSM2777_07230(ddl)
PFQ: QQ39_04490(ddl)
LRI: NCTC12151_02610(ddlB)
PSHI: SAMEA2665130_0390(ddlB)
HIN: HI1140(ddl)
HIT: NTHI1308(ddlB)
HIP: CGSHiEE_06350(ddl)
HIU: HIB_12970
HIE: R2846_1202(ddlB)
HIZ: R2866_1261(ddlB)
HIK: HifGL_001487(ddl)
HIA: H733_1316
HIW: NTHI477_00597(ddlB)
HIC: NTHIC486_01602(ddlB)
HIX: NTHI723_00504(ddlB)
HDU: HD_0821(ddlB)
HAP: HAPS_0121(ddl)
HPAZ: K756_06470(ddl)
HPAS: JL26_05455
HPAK: JT17_03000
HSO: HS_0360(ddl)
HSM: HSM_0630
PMU: PM0144(ddlB)
PMV: PMCN06_1158(ddlB)
PMP: Pmu_11690(ddl)
PMUL: DR93_1922
PDAG: 4362423_00244(ddlB)
MSU: MS1664(ddlA)
MHQ: D650_5010
MHAT: B824_5790
MHX: MHH_c00810(ddlB)
MHAE: F382_05545(ddl)
MHAM: J450_04890(ddl)
MHAO: J451_05785(ddl)
MHAL: N220_11685(ddl)
MHAQ: WC39_02530
MHAY: VK67_02535
MVR: X781_4200
MVE: X875_3550
APL: APL_0020(ddlB)
APJ: APJL_0021(ddlB)
APA: APP7_0020(ddlB)
ASU: Asuc_1930
ASI: ASU2_07090(ddl)
ASS: ASU1_07165(ddl)
AAT: D11S_0788
AAN: D7S_03235
AACN: AANUM_0999
BTO: WQG_5570
BTRE: F542_16480
BTRH: F543_18180
BTRA: F544_5890
XFA: XF_0799
XFT: PD_1864(ddlB)
XFF: XFLM_03780(ddl)
XCC: XCC0222(ddl) XCC0727(ddl)
XCV: XCV0246(ddlA) XCV0832(ddlB)
XAX: XACM_0226(ddlA) XACM_0777(ddl)
XAC: XAC0781(ddlB)
XCI: XCAW_03800(ddlA)
XFU: XFF4834R_chr07850(ddlB)
XAO: XAC29_03985(ddl)
XOO: XOO0352(ddlA) XOO3824(ddlB)
XOM: XOO0324(XOO0324) XOO3602(XOO3602)
XAL: XALC_2812(ddl)
XPH: XppCFBP6546_07530(XppCFBP6546P_07530) XppCFBP6546_10710(XppCFBP6546P_10710)
SML: Smlt0211(ddlA) Smlt0757(ddlB)
SMZ: SMD_0180(ddlA) SMD_0645(ddlB)
SACZ: AOT14_35060(ddl)
PSUW: WQ53_11525
PSD: DSC_02890(ddl)
LAB: LA76x_1176(ddl)
LAQ: GLA29479_2029(ddlB)
LCP: LC55x_4269(ddl)
LGU: LG3211_4074(ddlB)
LEZ: GLE_4129(ddlA)
LEM: LEN_1065(ddlA)
DKO: I596_555
VCH: VCA0572(ddl)
VCS: MS6_A0622
VCE: Vch1786_II0260(ddl)
VCI: O3Y_16223(ddl)
VCO: VC0395_0515(ddlA)
VCR: VC395_A0743(ddlA)
VCM: VCM66_A0531(ddlA)
VVU: VV2_0280
VVY: VVA0785
VVL: VV93_v1c37750(ddl)
VPA: VPA0886(ddl)
VAG: N646_4283
VSP: VS_II0746
VEJ: VEJY3_19846(ddl)
VTA: B0565 B1685(ddl)
VFI: VF_A0570(ddl)
PAE: PA4201(ddlA) PA4410(ddlB)
PAEV: N297_4333 N297_4555(ddl)
PAEI: N296_4333 N296_4555(ddl)
PAU: PA14_09600(ddlA) PA14_57320(ddlB)
PAP: PSPA7_0897(ddlA) PSPA7_4982(ddlB)
PAG: PLES_07261(ddlA) PLES_47891(ddlB)
PAF: PAM18_0736(ddlA) PAM18_4501(ddl)
PNC: NCGM2_1193(ddl) NCGM2_5400(ddlA)
PAEB: NCGM1900_0758(ddlA) NCGM1900_2240(ddl)
PAEU: BN889_04675(ddlA_2) BN889_04902(ddl_1) BN889_04903(ddl_2)
PAEC: M802_4331 M802_4553(ddl)
PAEO: M801_4199 M801_4420(ddl)
PMY: Pmen_0924
PMK: MDS_1012
PRE: PCA10_10800(ddlB)
PPSE: BN5_3460
PCQ: PcP3B5_12230(ddl) PcP3B5_21220(ddlA)
PPU: PP_1339(ddlB) PP_4346(ddlA)
PPT: PPS_4354
PPB: PPUBIRD1_4224(ddl)
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CLL: CONCH_0643(ddlA)
CCC: G157_04910(ddl)
CCQ: N149_0740(ddlA)
CCF: YSQ_05410
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CPER: CPE2_0818(murC)
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LIS: LIL_11428 LIL_11978(ddlA)
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ABAC: LuPra_04603(ddl_1) LuPra_05846(ddl_2)
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