KEGG   ORTHOLOGY: K03041
Entry
K03041                      KO                                     
Symbol
rpoA1
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit A' [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03041
Other DBs
COG: COG0086
GO: 0003899
Genes
MJA: MJ_1042
MFE: Mefer_1264
MVU: Metvu_1534
MFS: MFS40622_1659
MIF: Metin_0647
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PSYT: DSAG12_03894(rpoA1)
 » show all
Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0692]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K16251
Entry
K16251                      KO                                     
Symbol
NRPE1
Name
DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol IV and V specific subunits
     K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K16251
Other DBs
GO: 0003899
Genes
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 » show all
Reference
  Authors
Ream TS, Haag JR, Wierzbicki AT, Nicora CD, Norbeck AD, Zhu JK, Hagen G, Guilfoyle TJ, Pasa-Tolic L, Pikaard CS
  Title
Subunit compositions of the RNA-silencing enzymes Pol IV and Pol V reveal their origins as specialized forms of RNA polymerase II.
  Journal
Mol Cell 33:192-203 (2009)
DOI:10.1016/j.molcel.2008.12.015
  Sequence
[ath:AT2G40030]

KEGG   ORTHOLOGY: K16250
Entry
K16250                      KO                                     
Symbol
NRPD1
Name
DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol IV and V specific subunits
     K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K16250
Other DBs
GO: 0003899
Genes
ATH: AT1G63020(NRPD1A)
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NCOL: 116247215
ATR: 18447780
PPP: 112294412
 » show all
Reference
  Authors
Ream TS, Haag JR, Wierzbicki AT, Nicora CD, Norbeck AD, Zhu JK, Hagen G, Guilfoyle TJ, Pasa-Tolic L, Pikaard CS
  Title
Subunit compositions of the RNA-silencing enzymes Pol IV and Pol V reveal their origins as specialized forms of RNA polymerase II.
  Journal
Mol Cell 33:192-203 (2009)
DOI:10.1016/j.molcel.2008.12.015
  Sequence
[ath:AT1G63020]

KEGG   ORTHOLOGY: K03042
Entry
K03042                      KO                                     
Symbol
rpoA2
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit A" [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03042
Other DBs
COG: COG0086
GO: 0003899
Genes
MEDW: NCTC10132_00889(rpoC_2)
MALA: NCTC10135_00269(rpoC_4)
PCAG: NCTC12856_01825(rpoBC)
MJA: MJ_1043
MFE: Mefer_1265
MVU: Metvu_1533
MFS: MFS40622_1660
MIF: Metin_0646
MJH: JH146_0899
MESG: MLAUSG7_1525(rpoA)
MESA: MLASG1_1149(rpoA)
MMP: MMP1364(rpoA2)
MMD: GYY_07650
MMAK: MMKA1_15880(rpoA2)
MMAO: MMOS7_14690(rpoA2)
MMAD: MMJJ_14750(rpoC_1)
MAE: Maeo_0788
MVO: Mvol_1026
METF: CFE53_01335(rpoA2)
MTH: MTH_1052
MMG: MTBMA_c14390(rpoA2)
MWO: MWSIV6_1438(rpoA2)
MTEE: MTTB_03760
METC: MTCT_0955
METE: tca_01016(rpoC_4)
METK: FVF72_06330(rpoA2)
MTHM: FZP57_06885(rpoA2)
METJ: FZP68_03755(rpoA2)
MST: Msp_1372(rpoA2)
MEIS: PXD04_00260(rpoA2)
MRU: mru_1814(rpoA2)
MSI: Msm_0908
MEB: Abm4_0349(rpoA2)
MMIL: sm9_1859(rpoA2)
MEYE: TL18_08730
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METV: K4897_06945(rpoA2)
METH: MBMB1_0234(rpoA2)
MFC: BRM9_2070(rpoA2)
MFI: DSM1535_1616(rpoA2)
MCUB: MCBB_0255(rpoA2)
METT: CIT01_03005(rpoA2)
METO: CIT02_05845(rpoA2)
MEME: HYG87_04245(rpoA2)
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PFU: PF1562
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PYN: PNA2_0130
PYS: Py04_1438
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TON: TON_0219
TGA: TGAM_1924(rpoA2)
TSI: TSIB_0390
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TLT: OCC_06006
THS: TES1_0329
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THEI: K1720_05030(rpoA2)
PPAC: PAP_02720
MBAR: MSBR2_1506
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MTHR: MSTHT_1002
MTHE: MSTHC_2304
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MBU: Mbur_1176(rpoA2)
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MMH: Mmah_0532
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MEHF: MmiHf6_02220(rpoC_2)
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MTP: Mthe_0030
MCJ: MCON_1278(rpoA2)
MHI: Mhar_0384
MHU: Mhun_0053
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MLA: Mlab_1160
MBG: BN140_0183(rpoA2)
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MCHK: MchiMG62_04270(rpoA2)
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MPI: Mpet_1734
MEND: L6E24_01620(rpoA2)
MEFW: F1737_03420(rpoA2)
MAQE: RJ40_04775(rpoA2)
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MESB: L1S32_01475(rpoA2)
MANQ: L1994_05000(rpoA2)
MBN: Mboo_1931
MPL: Mpal_2162
MPD: MCP_1219(rpoA2)
MEZ: Mtc_2147(rpoA2)
RCI: LRC358(rpoA2)
HAL: VNG_2662G(rpoC)
HSL: OE_4739R(rpoA2)
HANR: LJ422_10785(rpoA2)
HHB: Hhub_1251(rpoA2)
HAGS: JT689_12220(rpoA2)
HABO: JRZ79_10500(rpoA2)
HNO: LT974_01040(rpoA2)
HLU: LT972_12545(rpoA2)
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HHSR: HSR6_1603(rpoA2)
HSU: HLASF_0503(rpoA1)
HSF: HLASA_0500(rpoA1)
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SALR: FQU85_03225(rpoA2)
HALR: EFA46_005000(rpoA2)
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SAIM: K0C01_01035(rpoA2)
HARA: AArcS_2857(rpoA2)
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HALZ: E5139_05680(rpoA2)
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HAJ: DU500_01230(rpoA2)
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HALP: DOS48_00530(rpoA2)
HALB: EKH57_11880(rpoA2)
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HSAI: HPS36_06185(rpoA2)
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HALG: HUG10_17350(rpoA2)
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HMP: K6T50_12575(rpoA2)
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HJT: DVR14_08210(rpoA2)
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NAS: GCU68_04760(rpoA2)
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TAG: Tagg_1405
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AGW: QT03_C0001G0841(rpoA2)
 » show all
Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0691]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03047
Entry
K03047                      KO                                     
Symbol
rpoD
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit D [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03047
Other DBs
COG: COG0202
GO: 0003899
Genes
ADC: FOC79_08995
MJA: MJ_0192
MFE: Mefer_0487
MVU: Metvu_1634
MFS: MFS40622_0085
MIF: Metin_0698
MJH: JH146_1612
MESG: MLAUSG7_0380(rpoD)
MESA: MLASG1_1559(rpoD)
MIG: Metig_0862
MMP: MMP1322(rpoD)
MMD: GYY_07435
MMAK: MMKA1_15450(rpoD)
MMAO: MMOS7_14260(rpoD)
MMAD: MMJJ_15180
MAE: Maeo_1098
MVO: Mvol_0217
MTH: MTH_37
MMG: MTBMA_c05260(rpoD)
MWO: MWSIV6_0491(rpoD)
MTEE: MTTB_11050
METC: MTCT_0036
METE: tca_00037(rpoA)
MST: Msp_0868(rpoD)
MRU: mru_0908(rpoD)
MSI: Msm_1428
MEB: Abm4_1240(rpoD)
MMIL: sm9_1651(rpoD)
MEYE: TL18_07310
MOL: YLM1_0475
METH: MBMB1_0801(rpoD)
MFC: BRM9_0373(rpoD)
MFI: DSM1535_0300(rpoD)
MCUB: MCBB_1347(rpoD)
MFV: Mfer_0886
MKA: MK1474(rpoA)
AFU: AF_2282
FPL: Ferp_0845
GAC: GACE_0207
GAH: GAH_00088
PFU: PF1647
PFI: PFC_10370
PHO: PH1637(PH1637)
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PYN: PNA2_0221
PYS: Py04_1528
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TGA: TGAM_1966(rpoD)
TSI: TSIB_0342
THE: GQS_04705
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THM: CL1_0593
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03059
Entry
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Name
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03058
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K03058                      KO                                     
Symbol
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  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
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 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03049
Entry
K03049                      KO                                     
Symbol
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Name
DNA-directed RNA polymerase subunit E' [EC:2.7.7.6]
Pathway
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Brite
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  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
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 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03049
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03045
Entry
K03045                      KO                                     
Symbol
rpoB2
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit B" [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
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 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
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 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03045
Other DBs
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MEMA: MMAB1_0230(rpoB)
MPI: Mpet_1737
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MBN: Mboo_1934
MPL: Mpal_2159
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HSF: HLASA_0497(rpoB2)
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K13798
Entry
K13798                      KO                                     
Symbol
rpoB
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit B [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
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 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K13798
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Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0693]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

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