KEGG   ORTHOLOGY: K03041
Entry
K03041                      KO                                     
Symbol
rpoA1
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit A' [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03041  rpoA1; DNA-directed RNA polymerase subunit A'
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03041
Other DBs
COG: COG0086
GO: 0003899
Genes
MJA: MJ_1042
MFE: Mefer_1264
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MFS: MFS40622_1659
MIF: Metin_0647
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 » show all
Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0692]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K16251
Entry
K16251                      KO                                     
Symbol
NRPE1
Name
DNA-directed RNA polymerase V subunit 1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol IV and V specific subunits
     K16251  NRPE1; DNA-directed RNA polymerase V subunit 1
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K16251
Other DBs
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Genes
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NCOL: 116257001
CJF: 131064457
 » show all
Reference
  Authors
Ream TS, Haag JR, Wierzbicki AT, Nicora CD, Norbeck AD, Zhu JK, Hagen G, Guilfoyle TJ, Pasa-Tolic L, Pikaard CS
  Title
Subunit compositions of the RNA-silencing enzymes Pol IV and Pol V reveal their origins as specialized forms of RNA polymerase II.
  Journal
Mol Cell 33:192-203 (2009)
DOI:10.1016/j.molcel.2008.12.015
  Sequence
[ath:AT2G40030]

KEGG   ORTHOLOGY: K16250
Entry
K16250                      KO                                     
Symbol
NRPD1
Name
DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1 [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   RNA polymerase II
    Pol IV and V specific subunits
     K16250  NRPD1; DNA-directed RNA polymerase IV subunit 1
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K16250
Other DBs
GO: 0003899
Genes
OSA: 4336722 4347810
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ATR: 18447780
CJF: 131048700
PPP: 112294412
 » show all
Reference
  Authors
Ream TS, Haag JR, Wierzbicki AT, Nicora CD, Norbeck AD, Zhu JK, Hagen G, Guilfoyle TJ, Pasa-Tolic L, Pikaard CS
  Title
Subunit compositions of the RNA-silencing enzymes Pol IV and Pol V reveal their origins as specialized forms of RNA polymerase II.
  Journal
Mol Cell 33:192-203 (2009)
DOI:10.1016/j.molcel.2008.12.015
  Sequence
[ath:AT1G63020]

KEGG   ORTHOLOGY: K03042
Entry
K03042                      KO                                     
Symbol
rpoA2
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit A" [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03042  rpoA2; DNA-directed RNA polymerase subunit A"
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03042
Other DBs
COG: COG0086
GO: 0003899
Genes
PCAG: NCTC12856_01825(rpoBC)
MEDW: NCTC10132_00889(rpoC_2)
MALA: NCTC10135_00269(rpoC_4)
MJA: MJ_1043
MFE: Mefer_1265
MVU: Metvu_1533
MFS: MFS40622_1660
MIF: Metin_0646
MJH: JH146_0899
MESG: MLAUSG7_1525(rpoA)
MESA: MLASG1_1149(rpoA)
MMP: MMP1364(rpoA2)
MMD: GYY_07650
MMAK: MMKA1_15880(rpoA2)
MMAO: MMOS7_14690(rpoA2)
MMAD: MMJJ_14750(rpoC_1)
MAE: Maeo_0788
MVO: Mvol_1026
MMVI: ACS5L2_06525(rpoA2)
METF: CFE53_01335(rpoA2)
MTH: MTH_1052
MMG: MTBMA_c14390(rpoA2)
MWO: MWSIV6_1438(rpoA2)
MTEE: MTTB_03760
METC: MTCT_0955
METE: tca_01016(rpoC_4)
METK: FVF72_06330(rpoA2)
MTHM: FZP57_06885(rpoA2)
METJ: FZP68_03755(rpoA2)
MST: Msp_1372(rpoA2)
MEIS: PXD04_00260(rpoA2)
MRU: mru_1814(rpoA2)
MSI: Msm_0908
MEB: Abm4_0349(rpoA2)
MMIL: sm9_1859(rpoA2)
MEYE: TL18_08730
MOL: YLM1_1274
METV: K4897_06945(rpoA2)
METH: MBMB1_0234(rpoA2)
MFC: BRM9_2070(rpoA2)
MFI: DSM1535_1616(rpoA2)
MCUB: MCBB_0255(rpoA2)
METT: CIT01_03005(rpoA2)
METO: CIT02_05845(rpoA2)
MEME: HYG87_04245(rpoA2)
MRID: FGU46_03960(rpoA2)
MFV: Mfer_0650
MKA: MK0684(rpoC_1)
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FPL: Ferp_0760
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PFI: PFC_07040
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PAB: PAB0425(rpoA2)
PYN: PNA2_0130
PYS: Py04_1438
PWE: ACMFNG_00420(rpoA2)
TKO: TK1081
TON: TON_0219
TGA: TGAM_1924(rpoA2)
TSI: TSIB_0390
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THA: TAM4_1482
THM: CL1_0442
TLT: OCC_06006
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TEU: TEU_06575
THH: CDI07_01925(rpoA2)
TIC: FH039_04135(rpoA2)
TCQ: TIRI35C_0618(rpoA)
THEM: FPV09_05185(rpoA2)
THEI: K1720_05030(rpoA2)
TAGG: NF865_00805(rpoA2)
PPAC: PAP_02720
MBAR: MSBR2_1506
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MAC: MA_1262(rpoA2)
MMA: MM_2270
MMAC: MSMAC_2019
METM: MSMTP_0830
MTHR: MSTHT_1002
MTHE: MSTHC_2304
MHOR: MSHOH_1029
MFZ: AOB57_011450(rpoA2)
MHAB: RSJ42_02285(rpoA2)
MMAJ: ACSAZL_14515(rpoA2)
MSDS: ACSAZK_05465(rpoA2)
MBU: Mbur_1176(rpoA2)
MMET: MCMEM_1644
MELO: J7W08_07075(rpoA2)
MMH: Mmah_0532
MPY: Mpsy_1009
MZI: HWN40_03440(rpoA2)
MMAV: RE476_06745(rpoA2)
MSEB: RE474_03060(rpoA2)
MEHF: MmiHf6_02220(rpoC_2)
MEES: MmiEs2_07730(rpoC_1)
MTP: Mthe_0030
MCJ: MCON_1278(rpoA2)
MHI: Mhar_0384
MHU: Mhun_0053
MRTJ: KHC33_04440(rpoA2)
MLA: Mlab_1160
MBG: BN140_0183(rpoA2)
MEMA: MMAB1_0233(rpoA)
MCHK: MchiMG62_04270(rpoA2)
MSUM: OH143_08285(rpoA2)
MRC: R6Y96_02005(rpoA2)
MPI: Mpet_1734
MEND: L6E24_01620(rpoA2)
MEFW: F1737_03420(rpoA2)
MAQE: RJ40_04775(rpoA2)
MFK: E2N92_04980(rpoA2)
MOU: OU421_10275(rpoA2)
MESB: L1S32_01475(rpoA2)
MANQ: L1994_05000(rpoA2)
MBN: Mboo_1931
MPL: Mpal_2162
MPD: MCP_1219(rpoA2)
MEZ: Mtc_2147(rpoA2)
RCI: LRC358(rpoA2)
HAL: VNG_2662G(rpoC)
HSL: OE_4739R(rpoA2)
HANR: LJ422_10785(rpoA2)
HHB: Hhub_1251(rpoA2)
HAGS: JT689_12220(rpoA2)
HABO: JRZ79_10500(rpoA2)
HNO: LT974_01040(rpoA2)
HLU: LT972_12545(rpoA2)
HALH: HTSR_1532(rpoA2)
HHSR: HSR6_1603(rpoA2)
HSU: HLASF_0503(rpoA1)
HSF: HLASA_0500(rpoA1)
HAHS: HSRCO_0840(rpoA2)
SALR: FQU85_03225(rpoA2)
HALR: EFA46_005000(rpoA2)
HDO: MUK72_04115(rpoA2)
HALX: M0R89_09045(rpoA2)
HAXZ: M0R88_09445(rpoA2)
HAYC: NGM10_06435(rpoA2)
HAXY: NGM07_15005(rpoA2)
SALI: L593_13545
SAIM: K0C01_01035(rpoA2)
HARA: AArcS_2857(rpoA2)
HMA: rrnAC2427(rpoC)
HSIN: KDQ40_15165(rpoA2)
HHI: HAH_2859(rpoA'')
HALJ: G9465_05320(rpoA2)
HUT: Huta_0781
HTI: HTIA_0672
HALA: Hrd1104_01700(rpoA2)
HASV: SVXHr_0820(rpoA2)
HABN: HBNXHr_0808(rpoA2)
HMU: Hmuk_0512
HALZ: E5139_05680(rpoA2)
HALL: LC1Hm_2991(rpoA2)
HAZP: GBQ70_05675(rpoA2)
HSN: DV733_08745(rpoA2)
HDS: HSR122_0426(rpoC_Rpo11)
HRR: HZS55_10175(rpoA2)
HPEL: HZS54_14985(rpoA2)
HARC: HARCEL1_09270(rpoA2)
SSAI: N0B31_19045(rpoA2)
NPH: NP_0116A(rpoA2)
NMO: Nmlp_3842(rpoA2)
NHO: HWV23_07120(rpoA2)
NSAL: HWV07_09735(rpoA2)
HWA: HQ_3393A(rpoA2)
HWC: Hqrw_3919(rpoA2)
HVO: HVO_0350(rpoA2)
HALE: G3A49_01965(rpoA2)
HLN: SVXHx_0331(rpoA2)
HME: HFX_0336(rpoA'')
HLS: KU306_06450(rpoA2)
HDR: ACOZ39_00805(rpoA2)
HAQ: DU484_18290(rpoA2)
HAJ: DU500_01230(rpoA2)
HAER: DU502_16745(rpoA2)
HRA: EI982_14170(rpoA2)
HLM: DV707_02225(rpoA2)
HALM: FCF25_09155(rpoA2)
HLA: Hlac_0104
HALP: DOS48_00530(rpoA2)
HALB: EKH57_11880(rpoA2)
HEZZ: EO776_00550(rpoA2)
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HSAI: HPS36_06185(rpoA2)
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HXJ: ACOZ35_12620(rpoA2)
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HMP: K6T50_12575(rpoA2)
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HDF: AArcSl_0578(rpoA2)
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HSAL: JMJ58_07405(rpoA2)
HAKZ: J0X25_08315(rpoA2)
NMG: Nmag_2153(rpoA2)
NAT: NJ7G_0207
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NPL: FGF80_16185(rpoA2)
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DKA: DKAM_1373
TAG: Tagg_1405
TCS: IMZ38_00360(rpoA2)
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SJV: SJAV_12510(rpoA2)
SSO: SSO0223(rpoA2)
SOL: Ssol_1202
SSOA: SULA_1242(rpoA2)
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SCAS: SACC_01370
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MSE: Msed_0035
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MCN: Mcup_0035
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CSTY: KN1_18330
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PAS: Pars_2323
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MVJ: ACO0C9_03415(rpoA2)
BARC: AOA65_1212(rpoA2)
NEQ: NEQ427
NAA: Nps_00560
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MARV: ARM1_0545
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NOCC: SVXNc_0195(rpoA2)
LOKI: Lokiarch_36620(rpoA2_1) Lokiarch_42100(rpoA2_2)
PSYT: DSAG12_03893(rpoA2)
AGW: QT03_C0001G0841(rpoA2)
 » show all
Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0691]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

KEGG   ORTHOLOGY: K03047
Entry
K03047                      KO                                     
Symbol
rpoD
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit D [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03047  rpoD; DNA-directed RNA polymerase subunit D
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03047
Other DBs
COG: COG0202
GO: 0003899
Genes
ADC: FOC79_08995
MJA: MJ_0192
MFE: Mefer_0487
MVU: Metvu_1634
MFS: MFS40622_0085
MIF: Metin_0698
MJH: JH146_1612
MESG: MLAUSG7_0380(rpoD)
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
  Authors
Sano K, Taguchi A, Furumoto H, Uda T, Itoh T
  Title
Cloning, sequencing, and characterization of ribosomal protein and RNA polymerase genes from the region analogous to the alpha-operon of escherichia coli in  halophilic archaea, halobacterium halobium.
  Journal
Biochem Biophys Res Commun 264:24-8 (1999)
DOI:10.1006/bbrc.1999.1480
  Sequence
[hal:VNG_1136G]

KEGG   ORTHOLOGY: K03059
Entry
K03059                      KO                                     
Symbol
rpoP
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit P [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03059  rpoP; DNA-directed RNA polymerase subunit P
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03059  rpoP; DNA-directed RNA polymerase subunit P
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03059  rpoP; DNA-directed RNA polymerase subunit P
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03059  rpoP; DNA-directed RNA polymerase subunit P
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03059
Other DBs
COG: COG1996
GO: 0003899
Genes
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 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
  Authors
Korkhin Y, Unligil UM, Littlefield O, Nelson PJ, Stuart DI, Sigler PB, Bell SD, Abrescia NG
  Title
Evolution of complex RNA polymerases: the complete archaeal RNA polymerase structure.
  Journal
PLoS Biol 7:e1000102 (2009)
DOI:10.1371/journal.pbio.1000102
  Sequence

KEGG   ORTHOLOGY: K03058
Entry
K03058                      KO                                     
Symbol
rpoN
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit N [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03058  rpoN; DNA-directed RNA polymerase subunit N
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03058
Other DBs
COG: COG1644
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LOKI: Lokiarch_26180(rpoN)
 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
  Authors
Korkhin Y, Unligil UM, Littlefield O, Nelson PJ, Stuart DI, Sigler PB, Bell SD, Abrescia NG
  Title
Evolution of complex RNA polymerases: the complete archaeal RNA polymerase structure.
  Journal
PLoS Biol 7:e1000102 (2009)
DOI:10.1371/journal.pbio.1000102
  Sequence

KEGG   ORTHOLOGY: K03049
Entry
K03049                      KO                                     
Symbol
rpoE1
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit E' [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03049  rpoE1; DNA-directed RNA polymerase subunit E'
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03049
Other DBs
COG: COG1095
GO: 0003899
Genes
COO: CCU_27490
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MFS: MFS40622_0922
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LOKI: Lokiarch_06370(rpoE1_1) Lokiarch_41980(rpoE1_2)
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Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
  Authors
Wojtas MN, Mogni M, Millet O, Bell SD, Abrescia NG
  Title
Structural and functional analyses of the interaction of archaeal RNA polymerase with DNA.
  Journal
Nucleic Acids Res 40:9941-52 (2012)
DOI:10.1093/nar/gks692
  Sequence

KEGG   ORTHOLOGY: K03045
Entry
K03045                      KO                                     
Symbol
rpoB2
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit B" [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K03045  rpoB2; DNA-directed RNA polymerase subunit B"
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K03045
Other DBs
COG: COG0085
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COO: CCU_16420
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NOCC: SVXNc_0198(rpoB2)
NHF: HBNXNv_0945(rpoB2)
 » show all
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006
Reference
PMID:2495365
  Authors
Leffers H, Gropp F, Lottspeich F, Zillig W, Garrett RA
  Title
Sequence, organization, transcription and evolution of RNA polymerase subunit genes from the archaebacterial extreme halophiles Halobacterium halobium and  Halococcus morrhuae.
  Journal
J Mol Biol 206:1-17 (1989)
DOI:10.1016/0022-2836(89)90519-6
  Sequence
[hsl:OE_4742R]

KEGG   ORTHOLOGY: K13798
Entry
K13798                      KO                                     
Symbol
rpoB
Name
DNA-directed RNA polymerase subunit B [EC:2.7.7.6]
Pathway
map03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
Enzymes [BR:ko01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Archaeal type
   RNA polymerase
    Core subunits
     K13798  rpoB; DNA-directed RNA polymerase subunit B
RNA polymerases [br01611.html]
 RNA polymerases in prokaryotes and eukaryotes
  K13798
Other DBs
COG: COG0085
GO: 0003899
Genes
MEB: Abm4_0347(rpoB)
PFU: PF1564
PFI: PFC_07050
PHO: PH1546(PH1546)
PAB: PAB0423(rpoB)
PYN: PNA2_0132
PYA: PYCH_03890
PYS: Py04_1440
PYC: TQ32_09130
PWE: ACMFNG_00430
TKO: TK1083
TON: TON_0217
TGA: TGAM_1926(rpoB)
TSI: TSIB_0388
THE: GQS_03950
THA: TAM4_1722
THM: CL1_0440
TLT: OCC_06016
THS: TES1_0327
TNU: BD01_0187
TEU: TEU_06565
THH: CDI07_01935(rpoB)
TCQ: TIRI35C_0620(rpoB)
PPAC: PAP_02710
MELU: MTLP_09350
TAC: Ta0390
TVO: TVG1237894(TVG1237894)
PTO: PTO0259
FAI: FAD_0207
CDIV: CPM_1516
MEAR: Mpt1_c13890(rpoB1)
MARC: AR505_0054
ABI: Aboo_1091
APE: APE_1856(rpoB)
ACJ: ACAM_1165(rpoB)
SMR: Smar_0802
IHO: Igni_0651
IIS: EYM_06835
IPC: IPA_00165
DKA: DKAM_1375
TAG: Tagg_1407
IAG: Igag_1245
HBU: Hbut_1573
PABI: PABY_01680
PARE: PYJP_13980
STO: STK_02770(rpoB)
SOL: Ssol_1204
SSOA: SULA_1244
SSOL: SULB_1245
SSOF: SULC_1243
SCAS: SACC_01390
SID: M164_1918
SII: LD85_2132
SIH: SiH_1848
SIR: SiRe_1768
SIC: SiL_1763
SAI: Saci_0693(rpoB)
MSE: Msed_0033
MEMJ: MJ1HA_0034
MCN: Mcup_0033
AHO: Ahos_0748
ACIH: HS5_21220
CSTY: KN1_18350
STEP: IC006_1829
SAHS: HS7_07500
PAI: PAE0665
PIS: Pisl_0703
PCL: Pcal_2091
PAS: Pars_2321
PYR: P186_2178
POG: Pogu_2544
TNE: Tneu_1963
CMA: Cmaq_0449
TTN: TTX_1678(rpoB)
TUZ: TUZN_1833
VDI: Vdis_1210
VMO: VMUT_2058
TPE: Tpen_0286
ASC: ASAC_1175
ACIA: SE86_07035
KCR: Kcr_1523
NMR: Nmar_0347
NID: NPIRD3C_0751(rpoB)
NIN: NADRNF5_1905(rpoB)
NCL: C5F47_01840(rpoB)
NOX: C5F49_01835(rpoB)
NUE: C5F50_02450(rpoB)
NCT: NMSP_1361(rpoB1)
NGA: Ngar_c01550(rpoB)
NVN: NVIE_013510(rpoB)
NEV: NTE_02750
TAA: NMY3_01928(rpoB)
NFN: NFRAN_2735(rpoB)
NCV: NCAV_1495(rpoB)
NDV: NDEV_0312(rpoB)
CCAI: NAS2_0241
NBV: T478_0274(rpoB)
BARC: AOA65_1811(rpoB1)
BARB: AOA66_0159(rpoB1)
NAA: Nps_00550
MIY: Micr_00853(rpoB1_2)
LOKI: Lokiarch_03330(rpoB1_1) Lokiarch_29070(rpoB1_2)
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Reference
PMID:2501756
  Authors
Puhler G, Lottspeich F, Zillig W
  Title
Organization and nucleotide sequence of the genes encoding the large subunits A, B and C of the DNA-dependent RNA polymerase of the archaebacterium Sulfolobus acidocaldarius.
  Journal
Nucleic Acids Res 17:4517-34 (1989)
DOI:10.1093/nar/17.12.4517
  Sequence
[sai:Saci_0693]
Reference
  Authors
Hirata A, Murakami KS
  Title
Archaeal RNA polymerase.
  Journal
Curr Opin Struct Biol 19:724-31 (2009)
DOI:10.1016/j.sbi.2009.10.006

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