KEGG   ORTHOLOGY: K11446
Entry
K11446                      KO                                     

Name
KDM5, JARID1
Definition
[histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase [EC:1.14.11.67]
Disease
H00658  Syndromic X-linked mental retardation
H00768  Autosomal recessive mental retardation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01009 Protein phosphatases and associated proteins
    K11446  KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K11446  KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.11  With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
    1.14.11.67  [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
     K11446  KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
Protein phosphatases and associated proteins [BR:ko01009]
 Protein serine/threonine phosphatases
  Phosphoprotein phosphatases (PPPs)
   Protein phosphatase-1
    PP1-interacting proteins (PIPs)
     K11446  KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic type
  Histone modification proteins
   Histone demethylases
    K11446  KDM5, JARID1; [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
Other DBs
GO: 0034647 GO:0034648
Genes
HSA: 10765(KDM5B) 5927(KDM5A) 8242(KDM5C) 8284(KDM5D)
PTR: 449032(KDM5D) 451737(KDM5A) 457630(KDM5B) 744380(KDM5C)
PPS: 100969555(KDM5B) 100970129(KDM5C) 100980071(KDM5A)
GGO: 101127412(KDM5C) 101149215(KDM5A) 101153769(KDM5B)
PON: 100172643(KDM5C) 100434572(KDM5A) 100450767(KDM5B)
NLE: 100590577(KDM5C) 100591974(KDM5B) 100593603(KDM5A)
MCC: 100270697(KDM5D) 106992262(KDM5C) 706437(KDM5B) 721599(KDM5A)
MCF: 102118086(KDM5C) 102126562(KDM5B) 102140751(KDM5A)
CSAB: 103218353(KDM5A) 103230303(KDM5B) 103232010(KDM5C) 103246987(KDM5D)
RRO: 104658712(KDM5D) 104663374(KDM5C) 104672250(KDM5A) 104674506(KDM5B)
RBB: 108523797 108523849(KDM5A) 108545038(KDM5B)
CJC: 100399585 100401370(KDM5C) 100405218(KDM5B)
SBQ: 101040986(KDM5C) 101053880(KDM5A) 101054224(KDM5B)
MMU: 20591(Kdm5c) 20592(Kdm5d) 214899(Kdm5a) 75605(Kdm5b)
MCAL: 110286928(Kdm5c) 110295764(Kdm5a) 110304747(Kdm5b)
MPAH: 110313472(Kdm5c) 110316599(Kdm5a) 110322297(Kdm5b)
RNO: 100312983(Kdm5d) 304809(Kdm5b) 312678(Kdm5a) 317432(Kdm5c)
MUN: 110546054(Kdm5a) 110546738(Kdm5b) 110566279(Kdm5c)
CGE: 100757111(Kdm5a) 100758549(Kdm5c) 100761435(Kdm5b)
NGI: 103731840(Kdm5b) 103739366(Kdm5a) 103747323(Kdm5c)
HGL: 101697034(Kdm5a) 101709640(Kdm5c) 101711865(Kdm5b)
CCAN: 109684662 109686312(Kdm5b) 109694623(Kdm5a) 109702638
OCU: 100341721(KDM5C) 100351408(KDM5A) 100356218(KDM5B)
TUP: 102477639(KDM5B) 102483934(KDM5C) 102494185(KDM5A)
CFA: 477727(KDM5A) 479999(KDM5B) 491894(KDM5C)
VVP: 112911956(KDM5C) 112911964 112917407(KDM5A) 112934568(KDM5B)
AML: 100476032(KDM5A) 100483283(KDM5B) 100484551(KDM5C)
UMR: 103657783(KDM5B) 103675225 103675721(KDM5A)
UAH: 113242535(KDM5B) 113247519(KDM5C) 113258031(KDM5A)
ORO: 101370942(KDM5B) 101371710(KDM5C) 101372331(KDM5A) 101375635
FCA: 101087846(KDM5A) 101091600(KDM5C) 101101609(KDM5B)
PTG: 102953605(KDM5B) 102957240(KDM5C) 102962286(KDM5A) 102965571
PPAD: 109256462(KDM5B) 109260277(KDM5C) 109276231(KDM5A)
AJU: 106965399(KDM5A) 106974127(KDM5B) 106985380(KDM5C) 106989091
BTA: 281490(KDM5C) 507962(KDM5A) 540633(KDM5B)
BOM: 102271619(KDM5A) 102276246(KDM5B) 102285874(KDM5C)
BIU: 109555159(KDM5C) 109559764(KDM5A) 109570476(KDM5B)
BBUB: 102393119(KDM5A) 102405105(KDM5C) 102408415(KDM5B)
CHX: 102178381(KDM5B) 102183856(KDM5A) 102185641(KDM5C)
OAS: 101110351(KDM5B) 101115023(KDM5A) 101121317(KDM5C)
SSC: 100037295(KDM5C) 100294704(KDM5A) 102163404(KDM5B) 110257883
CFR: 102504875(KDM5B) 102505415(KDM5C) 102520574(KDM5A) 102523369
CDK: 105096692(KDM5C) 105102938(KDM5A) 105105928(KDM5B)
BACU: 103009652(KDM5D) 103009914(KDM5B) 103010727(KDM5A) 103011953(KDM5C)
LVE: 103072576(KDM5B) 103083652(KDM5A) 103088289(KDM5C)
OOR: 101270071(KDM5A) 101271172(KDM5C) 101288712(KDM5B)
DLE: 111168309(KDM5B) 111170781(KDM5C) 111176614(KDM5A)
PCAD: 102983382(KDM5B) 102988928(KDM5A) 102992593(KDM5C)
ECB: 100034190(KDM5C) 100056935(KDM5A) 100064707(KDM5B)
EPZ: 103543421 103555110(KDM5B)
EAI: 106827754(KDM5C) 106831523(KDM5A) 106836255 106840227(KDM5B)
MYB: 102239080(KDM5B) 102245023(KDM5C) 102255481(KDM5A)
MYD: 102752699(KDM5A) 102762785(KDM5B) 102775396(KDM5C)
MNA: 107536012(KDM5B) 107542357(KDM5C) 107542684 107546447(KDM5A)
HAI: 109380463(KDM5B) 109388945(KDM5A) 109396384(KDM5C)
DRO: 112311208(KDM5A) 112318809(KDM5B) 112322361(KDM5C)
PALE: 102878118(KDM5A) 102882705(KDM5B) 102883012(KDM5C) 102887656
RAY: 107502986(KDM5B) 107503761(KDM5C) 107509747(KDM5A)
MJV: 108384283(KDM5C) 108396319(KDM5B) 108399069(KDM5A)
LAV: 100660048(KDM5C) 100665887(KDM5A) 100675094(KDM5B)
MDO: 100011885(KDM5B) 100020718(KDM5A) 100379644(KDM5C)
SHR: 100921713(KDM5A) 100925521(KDM5B) 116420405
PCW: 110201022 110218651(KDM5A) 110219561(KDM5B)
OAA: 100075501(KDM5C) 100077577(KDM5B) 100080164(KDM5A)
GGA: 418148(KDM5A) 421168(KDM5B)
MGP: 100548982(KDM5B)
CJO: 107315373(KDM5A) 107324646(KDM5B)
NMEL: 110388134(KDM5B) 110398370(KDM5A)
APLA: 101794048(KDM5A) 101802603(KDM5B)
ACYG: 106030948(KDM5A) 106045876(KDM5B)
TGU: 100220128(KDM5B) 100226987(KDM5A)
LSR: 110469157(KDM5B) 110472936(KDM5A)
SCAN: 103820453(KDM5A) 103822358(KDM5B)
GFR: 102036946(KDM5B) 102042789(KDM5A)
FAB: 101810162(KDM5A) 101819778(KDM5B)
PHI: 102102154(KDM5B) 102104485(KDM5A) 102111304(KDM5C)
PMAJ: 107204784(KDM5A) 107214918(KDM5B)
CCAE: 111927901(KDM5A) 111939719(KDM5B)
CCW: 104692233(KDM5A) 104692454(KDM5B)
ETL: 114064760(KDM5B) 114069392(KDM5A)
FPG: 101914016(KDM5B) 101916107(KDM5A) 101921902(KDM5C)
FCH: 102046513(KDM5C) 102048054(KDM5B) 102049474(KDM5A)
CLV: 102091315(KDM5B) 102097139(KDM5A)
EGZ: 104122023(KDM5B) 104129750(KDM5A)
NNI: 104011099(KDM5B) 104020219(KDM5A)
ACUN: 113488968(KDM5B) 113491464(KDM5A)
PADL: 103913826(KDM5B) 103924376(KDM5A)
AAM: 106488690(KDM5A) 106500239(KDM5B)
AMJ: 102562466(KDM5C) 102563181(KDM5B) 106736739(KDM5A)
PSS: 102450369(KDM5A) 102451841
CMY: 102934613(KDM5B) 102937991(KDM5A)
CPIC: 101942004(KDM5B) 101948551(KDM5A) 101952359(KDM5C)
ACS: 100562154(kdm5a) 100562356(kdm5b) 100565551(kdm5c)
PVT: 110073373(KDM5B) 110076663(KDM5A) 110078625(KDM5C)
PBI: 103057421(KDM5C) 103064844(KDM5A) 103067839(KDM5B)
PMUR: 107285905(KDM5A) 107287109(KDM5B) 107289352(KDM5C)
TSR: 106543320(KDM5B) 106544479 106550471(KDM5A)
PMUA: 114587654(KDM5C) 114599455(KDM5B) 114605015(KDM5A)
GJA: 107105528 107107867(KDM5B) 107120238(KDM5A)
XLA: 108699964(kdm5c.S) 108704489(kdm5c.L) 108704575 108708118 108709501(kdm5b.S) 108712258
XTR: 100488170(kdm5b) 100492348(kdm5a) 780176(kdm5c)
NPR: 108787373(KDM5B) 108788900(KDM5C) 108804616(KDM5A)
DRE: 100333310(kdm5a) 327168(kdm5ba) 415256(kdm5bb) 553406(kdm5c)
IPU: 108254769 108265475 108265643(kdm5bb) 108279764(kdm5a)
NCC: 104953602(kdm5b)
PRET: 103459510(kdm5a) 103465305 103467711(kdm5c) 103467750
ALIM: 106513272(kdm5b) 106519344 106521815(kdm5a) 106527724
AOCE: 111572088 111573173(kdm5a) 111579740 111580302(kdm5c)
SLAL: 111651986(kdm5a) 111654193(kdm5c) 111661918 111667789
HCQ: 109512943(kdm5c) 109522375(kdm5b) 109530074(kdm5a)
BPEC: 110164505 110164696(kdm5c) 110164872(kdm5a) 110171262
MALB: 109956240 109960867(kdm5a) 109966708(kdm5c) 109970307
PKI: 111833285(kdm5a) 111839833(kdm5b) 111847775
LCM: 102354446 102357112(KDM5A) 102367371(KDM5B)
CMK: 103181874(kdm5a) 103190333(kdm5b)
CIN: 778759
SPU: 578457
APLC: 110974950
SKO: 100376922
DME: Dmel_CG9088(lid)
DER: 6540673
DSE: 6613558
DSI: Dsimw501_GD22616(Dsim_GD22616)
DAN: 6497117
DSR: 110185577
DPE: 6589743
DMN: 108162737
DWI: 6642661
DAZ: 108610621
DNV: 108649376
DHE: 111602297
DVI: 6628917
MDE: 101900476
LCQ: 111679656
AAG: 5574390
AME: 410874
BIM: 100744731
BTER: 100648929
CCAL: 108623075
OBB: 114883217
SOC: 105204666
MPHA: 105837910
AEC: 105145222
ACEP: 105617083
PBAR: 105423324
VEM: 105565846
HST: 105181157
DQU: 106746492
CFO: 105258084
LHU: 105671686
PGC: 109852955
OBO: 105285592
PCF: 106787082
NVI: 100120294
CSOL: 105359430
MDL: 103569442
TCA: 103314648
DPA: 109540983
ATD: 109598089
NVL: 108567195
HAW: 110371606
API: 100163705
DNX: 107174064
AGS: 114123745
RMD: 113550660
BTAB: 109034748
CLEC: 106666620
ZNE: 110834947
FCD: 110861779
PVM: 113822739
TUT: 107371409
DPTE: 113795667
CSCU: 111633283
PTEP: 107441111
CEL: CELE_ZK593.4(rbr-2)
CBR: CBG05959(Cbr-rbr-2)
BMY: Bm1_31510
PCAN: 112571484
CRG: 105342266
OBI: 106868491
LAK: 106176719
SHX: MS3_04542
EPA: 110247338
ADF: 107340938
AMIL: 114969044
PDAM: 113683111
SPIS: 111339408
DGT: 114521659
HMG: 100214586(kdm5a)
AQU: 100639023
ATH: AT1G63490
ALY: 9324019
CRB: 17894403
BRP: 103838273
BOE: 106318075
RSZ: 108827565
THJ: 104818027
CIT: 102617380
TCC: 18606515
GRA: 105792217
GHI: 107936696
GAB: 108469525
DZI: 111277986
EGR: 104441751
GMX: 100789512
GSJ: 114376769
VRA: 106777566
VAR: 108335641
VUN: 114174716
CCAJ: 109801296
CAM: 101496163
LJA: Lj2g3v2017660.2(Lj2g3v2017660.2)
ADU: 107488264
AIP: 107643076
LANG: 109331235
FVE: 101303512
RCN: 112180802
PPER: 18776513
PMUM: 103337463
PAVI: 110758014
MDM: 103454748
PXB: 103954804
ZJU: 107429894
CSV: 101216734
CMO: 103482743
MCHA: 111026169
CMAX: 111468889
CMOS: 111435652
CPEP: 111808172
JCU: 105645808
HBR: 110672143
MESC: 110627589
POP: 18097038
PEU: 105124388
JRE: 108984403
VVI: 100261599
SLY: 101259658
SPEN: 107028578
SOT: 102601233
CANN: 107865060
NSY: 104218212
NTO: 104110228
NAU: 109242262
INI: 109153058
SIND: 105157801
OEU: 111375128
HAN: 110922607
LSV: 111920830
CCAV: 112528803
DCR: 108208906
BVG: 104907854
SOE: 110778623
NNU: 104596082
OSA: 9271593
DOSA: Os06t0731600-00(Os06g0731600)
OBR: 102708534
BDI: 100829070
ATS: 109777849(LOC109777849)
SBI: 8066399
ZMA: 103626493
SITA: 101767595
PDA: 103705556
EGU: 105054844
MUS: 103998506
DCT: 110102954
PEQ: 110018573
AOF: 109847387
ATR: 18423039
SCE: YJR119C(JHD2)
ERC: Ecym_7196
KMX: KLMA_60433(JHD2)
NCS: NCAS_0H00320(NCAS0H00320)
NDI: NDAI_0D00270(NDAI0D00270)
TPF: TPHA_0E00310(TPHA0E00310)
TBL: TBLA_0J00310(TBLA0J00310)
TDL: TDEL_0H00660(TDEL0H00660)
KAF: KAFR_0A03230(KAFR0A03230)
PIC: PICST_88926(RBP2)
CAL: CAALFM_C400260WA(CaO19.5651)
NCR: NCU01238
NTE: NEUTE1DRAFT127630(NEUTE1DRAFT_127630)
MGR: MGG_04878
SSCK: SPSK_08278
NHE: NECHADRAFT_49243(JMJ2102)
MAW: MAC_04053
MAJ: MAA_01434
CMT: CCM_07966
BFU: BCIN_02g00190(Bcecm5)
MBE: MBM_08533
ANI: AN8211.2
ANG: ANI_1_734084(An09g05800)
ABE: ARB_06850
TVE: TRV_05239
PTE: PTT_07707
CNE: CND05870
CNB: CNBD0520
TASA: A1Q1_03515
LBC: LACBIDRAFT_311495(JMJ16202)
ABP: AGABI1DRAFT119979(AGABI1DRAFT_119979)
ABV: AGABI2DRAFT188580(AGABI2DRAFT_188580)
MGL: MGL_2159
MRT: MRET_0349
SPAR: SPRG_10504
 » show all
Reference
  Authors
Christensen J, Agger K, Cloos PA, Pasini D, Rose S, Sennels L, Rappsilber J, Hansen KH, Salcini AE, Helin K
  Title
RBP2 belongs to a family of demethylases, specific for tri-and dimethylated lysine 4 on histone 3.
  Journal
Cell 128:1063-76 (2007)
DOI:10.1016/j.cell.2007.02.003
  Sequence
[hsa:5927 8242 10765] [mmu:214899] [cel:CELE_ZK593.4]
Reference
  Authors
Iwase S, Lan F, Bayliss P, de la Torre-Ubieta L, Huarte M, Qi HH, Whetstine JR, Bonni A, Roberts TM, Shi Y
  Title
The X-linked mental retardation gene SMCX/JARID1C defines a family of histone H3 lysine 4 demethylases.
  Journal
Cell 128:1077-88 (2007)
DOI:10.1016/j.cell.2007.02.017
  Sequence
[hsa:5927 8242 8284] [mmu:75605]

DBGET integrated database retrieval system