KEGG   ORTHOLOGY: K11446Help
Entry
K11446                      KO                                     

Name
KDM5, JARID1
Definition
histone demethylase JARID1 [EC:1.14.11.-]
Disease
H00658  Syndromic X-linked mental retardation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01009 Protein phosphatases and associated proteins
    K11446  KDM5, JARID1; histone demethylase JARID1
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins
    K11446  KDM5, JARID1; histone demethylase JARID1
Enzymes [BR:ko01000]
 1. Oxidoreductases
  1.14  Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen
   1.14.11  With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
    1.14.11.-  
     K11446  KDM5, JARID1; histone demethylase JARID1
Protein phosphatases and associated proteins [BR:ko01009]
 Protein Ser/ Thr phosphatases
  Phosphoprotein phosphatases (PPPs)
   Protein phosphatase-1
    PP1-interacting proteins (PIPs)
     K11446  KDM5, JARID1; histone demethylase JARID1
Chromosome and associated proteins [BR:ko03036]
 Eukaryotic Type
  Histone modification proteins
   Histone demethylases
    K11446  KDM5, JARID1; histone demethylase JARID1
BRITE hierarchy
Genes
HSA: 10765(KDM5B) 5927(KDM5A) 8242(KDM5C) 8284(KDM5D)
PTR: 449032(KDM5D) 451737(KDM5A) 457630(KDM5B) 744380(KDM5C)
PPS: 100969555(KDM5B) 100970129(KDM5C) 100980071(KDM5A)
GGO: 101127412(KDM5C) 101149215(KDM5A) 101153769(KDM5B)
PON: 100172643(KDM5C) 100434572(KDM5A) 100450767(KDM5B)
NLE: 100590577(KDM5C) 100591974(KDM5B) 100593603(KDM5A) 105738153
MCC: 100270697(KDM5D) 106992262(KDM5C) 706437(KDM5B) 721599(KDM5A)
MCF: 102118086(KDM5C) 102126562(KDM5B) 102140751(KDM5A)
CSAB: 103218353(KDM5A) 103230303(KDM5B) 103232010(KDM5C) 103246987(KDM5D)
RRO: 104658712 104662905 104663374(KDM5C) 104672250(KDM5A) 104674506(KDM5B)
SBQ: 101040986(KDM5C) 101053880(KDM5A) 101054224(KDM5B)
MMU: 20591(Kdm5c) 20592(Kdm5d) 214899(Kdm5a) 75605(Kdm5b)
RNO: 100312983(Kdm5d) 304809(Kdm5b) 312678(Kdm5a) 317432(Kdm5c)
CGE: 100757111(Kdm5a) 100758549(Kdm5c) 100761435(Kdm5b)
NGI: 103731840(Kdm5b) 103739366(Kdm5a) 103747323(Kdm5c)
HGL: 101697034(Kdm5a) 101709640(Kdm5c) 101711865(Kdm5b)
OCU: 100341721(KDM5C) 100351408(KDM5A) 100356218(KDM5B)
TUP: 102477639(KDM5B) 102483934(KDM5C) 102494185(KDM5A) 102494379
CFA: 477727(KDM5A) 479999(KDM5B) 491894(KDM5C)
AML: 100476032(KDM5A) 100483283(KDM5B) 100484551(KDM5C)
ORO: 101370942(KDM5B) 101371710(KDM5C) 101372331(KDM5A) 101375635
FCA: 101087846(KDM5A) 101091600(KDM5C) 101101609(KDM5B)
PTG: 102953605(KDM5B) 102957240(KDM5C) 102962286(KDM5A) 102965571
AJU: 106965399(KDM5A) 106974127(KDM5B) 106985380(KDM5C) 106989091
BTA: 281490(KDM5C) 507962(KDM5A) 540633(KDM5B)
BOM: 102271619(KDM5A) 102276246(KDM5B) 102285874(KDM5C)
BIU: 109555159(KDM5C) 109559764(KDM5A) 109570476(KDM5B)
PHD: 102326220(KDM5A) 102326501(KDM5B) 102336881(KDM5C)
CHX: 102178381(KDM5B) 102183856(KDM5A) 102185641(KDM5C)
SSC: 100037295(KDM5C) 100294704(KDM5A) 102163404(KDM5B) 110257883
CFR: 102504875(KDM5B) 102505415(KDM5C) 102519291 102520574(KDM5A) 102523369
BACU: 103009652(KDM5D) 103009914(KDM5B) 103010727(KDM5A) 103011953(KDM5C)
LVE: 103072576(KDM5B) 103083652(KDM5A) 103088289(KDM5C)
OOR: 101270071(KDM5A) 101271172(KDM5C) 101288712(KDM5B)
ECB: 100034190(KDM5C) 100056935(KDM5A) 100064707(KDM5B)
EAI: 106827754(KDM5C) 106831523(KDM5A) 106836255 106840227(KDM5B)
MYD: 102752699(KDM5A) 102762785(KDM5B) 102775396(KDM5C)
HAI: 109380463(KDM5B) 109388945(KDM5A) 109396384(KDM5C)
RSS: 109434413(KDM5A) 109438092(KDM5C) 109457741(KDM5B)
PALE: 102878118(KDM5A) 102882705(KDM5B) 102883012(KDM5C) 102887656
LAV: 100660048(KDM5C) 100665887(KDM5A) 100675094(KDM5B)
MDO: 100011885(KDM5B) 100020718(KDM5A) 100379644(KDM5C)
SHR: 100915015 100920680(KDM5C) 100921713(KDM5A) 100925521(KDM5B) 100931322(HNRNPU)
OAA: 100075501(KDM5C) 100077577(KDM5B) 100080164(KDM5A)
GGA: 418148(KDM5A) 421168(KDM5B)
MGP: 100543349(KDM5A) 100548982(KDM5B)
CJO: 107307756 107315373(KDM5A) 107324646(KDM5B)
APLA: 101790186 101794048(KDM5A) 101802603(KDM5B)
ACYG: 106030948(KDM5A) 106045876(KDM5B)
TGU: 100220128(KDM5B) 100226987(KDM5A)
SCAN: 103820453(KDM5A) 103822358(KDM5B)
GFR: 102036569 102036946(KDM5B) 102042789(KDM5A)
FAB: 101810162(KDM5A) 101819778(KDM5B)
PHI: 102102154(KDM5B) 102104485(KDM5A) 102111304(KDM5C)
PMAJ: 107199412 107204784(KDM5A) 107214918(KDM5B)
CCAE: 111927901(KDM5A) 111939719(KDM5B)
CCW: 104692233(KDM5A) 104692454(KDM5B)
FPG: 101914016(KDM5B) 101916107(KDM5A) 101921902(KDM5C)
FCH: 102046513(KDM5C) 102048054(KDM5B) 102049474(KDM5A)
CLV: 102091315(KDM5B) 102094750 102097139(KDM5A)
EGZ: 104122023(KDM5B) 104129750(KDM5A)
NNI: 104009118 104011099(KDM5B) 104020219(KDM5A)
ACUN: 113488968(KDM5B) 113491464(KDM5A)
AAM: 106488690(KDM5A) 106493906 106500239(KDM5B)
AMJ: 102562466(KDM5C) 102563181(KDM5B) 106736739(KDM5A)
CMY: 102934613(KDM5B) 102937991(KDM5A)
CPIC: 101937175 101942004(KDM5B) 101948551(KDM5A) 101952359(KDM5C)
ACS: 100562154(kdm5a) 100562356(kdm5b) 100565551(kdm5c)
PVT: 110073373(KDM5B) 110076663(KDM5A) 110078625(KDM5C)
PBI: 103057421(KDM5C) 103064844(KDM5A) 103067839(KDM5B) 103067939
PMUR: 107285905(KDM5A) 107287109(KDM5B) 107289352(KDM5C)
GJA: 107105528 107107867(KDM5B) 107120238(KDM5A)
XLA: 108699964(kdm5c.S) 108704489(kdm5c.L) 108704575 108708118 108709501(kdm5b.S) 108712258
XTR: 100488170(kdm5b) 100492348(kdm5a) 780176(kdm5c)
NPR: 108787373(KDM5B) 108788900(KDM5C) 108804616(KDM5A)
DRE: 100333310(kdm5a) 327168(kdm5ba) 415256(kdm5bb) 553406(kdm5c)
IPU: 108254769 108265475 108265643(kdm5bb) 108279764(kdm5a)
TRU: 101062233 101069859(kdm5b) 101076258(kdm5c) 101077353(kdm5a)
PRET: 103459510(kdm5a) 103465305 103467711(kdm5c) 103467750
HCQ: 109512943(kdm5c) 109522375(kdm5b) 109526864 109530074(kdm5a)
BPEC: 110164505 110164696(kdm5c) 110164872(kdm5a) 110171262
MALB: 109956240 109960867(kdm5a) 109966708(kdm5c) 109970307
ELS: 105016939(kdm5b) 105020259(kdm5a) 105022334 105022366(kdm5c)
LCM: 102354446 102357112(KDM5A) 102367371(KDM5B)
CMK: 103181874(kdm5a) 103190333(kdm5b)
CIN: 778759
APLC: 110974950
SKO: 100376922
DME: Dmel_CG9088(lid)
DER: 6540673
DPE: 6589743
DSI: Dsimw501_GD22616(Dsim_GD22616)
DWI: 6642661
MDE: 101900476
AAG: 5574390
AME: 410874
BIM: 100744731
BTER: 100648929
SOC: 105204666
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NVL: 108567195
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DPTE: 113795667
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LJA: Lj0g3v0287519.1(Lj0g3v0287519.1) Lj1g3v4515430.1(Lj1g3v4515430.1) Lj2g3v2017660.2(Lj2g3v2017660.2) Lj5g3v1265040.1(Lj5g3v1265040.1) Lj6g3v1116100.1(Lj6g3v1116100.1)
DOSA: Os03t0151300-01(Os03g0151300) Os05t0196500-01(Os05g0196500) Os05t0302300-01(Os05g0302300) Os06t0731600-00(Os06g0731600)
ATS: 109742693(LOC109742693) 109777849(LOC109777849) 109783037(LOC109783037)
SCE: YJR119C(JHD2)
ERC: Ecym_7196
KMX: KLMA_60433(JHD2)
NCS: NCAS_0H00320(NCAS0H00320)
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TDL: TDEL_0H00660(TDEL0H00660)
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PIC: PICST_88926(RBP2)
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SLB: AWJ20_4593 AWJ20_4594(ECM5) AWJ20_714(JHD2)
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SPO: SPAC343.11c(msc1) SPBP19A11.06(lid2)
CNE: CND05870
CNB: CNBD0520
LBC: LACBIDRAFT_311495(JMJ16202)
ABP: AGABI1DRAFT119979(AGABI1DRAFT_119979)
ABV: AGABI2DRAFT188580(AGABI2DRAFT_188580)
MGL: MGL_2159
DDI: DDB_G0268778(rbbB)
DFA: DFA_11947(rbbB)
TGO: TGME49_307010(JMJC1)
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TaxonomyKoalaUniProt
Reference
  Authors
Christensen J, Agger K, Cloos PA, Pasini D, Rose S, Sennels L, Rappsilber J, Hansen KH, Salcini AE, Helin K
  Title
RBP2 belongs to a family of demethylases, specific for tri-and dimethylated lysine 4 on histone 3.
  Journal
Cell 128:1063-76 (2007)
DOI:10.1016/j.cell.2007.02.003
  Sequence
[hsa:5927 8242 10765] [mmu:214899] [cel:CELE_ZK593.4]
Reference
  Authors
Iwase S, Lan F, Bayliss P, de la Torre-Ubieta L, Huarte M, Qi HH, Whetstine JR, Bonni A, Roberts TM, Shi Y
  Title
The X-linked mental retardation gene SMCX/JARID1C defines a family of histone H3 lysine 4 demethylases.
  Journal
Cell 128:1077-88 (2007)
DOI:10.1016/j.cell.2007.02.017
  Sequence
[hsa:5927 8242 8284] [mmu:75605]

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