KEGG   Lacinutrix venerupis: BWR22_00015
Entry
BWR22_00015       CDS       T04680                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
lvn  Lacinutrix venerupis
Pathway
lvn02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lvn00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    BWR22_00015
SSDB
Motif
Pfam: CHU_C fn3 MAM Reelin_subrepeat-B InhA-like_MAM Por_Secre_tail Pur_ac_phosph_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: APX98755
Position
complement(1198..6606)
AA seq 1802 aa
MRKTTLLLAGMLLFLGHIVNAQITTYPYSEDFEAGDGGWVADNATNGTWALGTPAATVIN
SAASGANSWTTNLTGEYNNSESSSVTSPVFDFSALLAPAITFNIWWESEFSWDGTVLQSS
IDGGTTWQNVGALGDAGNWYTDGTINGNPGGQQQGWTGRNGSGSNGWVTASHALTGLAGE
ASVQLRFAFGSDGSVPDEGVAFDDVTVFEVTCPEPSALTFISSTSSTANLSWTPGGGETA
WEVVVQPQGTGIPTGAGTGTTLNTGYEETGLTPATNYEAYVRSDCGGEFSIWVGPLNFAT
ECVTFVAPYTEGFENGGTIPLCWSMDGGEDWQFNTAGPNHVGNNGTLTGTTVTGNYYAVV
DASGDDGAITLTTPLVDVSTLTTPAITFYEISDNEGFANSQLDVEVWDGAAWNLMATYNT
NTSGWEQRTVNISTLNITGDVQARFIFSEVINSGDFYDDIAIDDVTFDELPSCVNPSNLA
VDSATDTTATLSWVSNGTETAWEVVVQAPGSGAPTGAGDAAATNPYTATGLTAATTYEYY
IRADCGGGEFSDWIGPLTFDTECTTYIAPYTEGFENGGVIPLCWSMDGGEDWQFNTAGPN
HVGDGGTLSGATATGNYYAVVDASGDDGAITLTTPLVDVSTLTTPALSFYEISDNEGNAN
SQLDVEVWDGAAWNLMGTYNTNTVGWELKIIDISTLTITGDVQARFIFSEVIAPGDFYDD
IAIDDVTFDELPPCVIPGGIAANNIAGTSADITWMAGGGETAWEYVIQPAGTGEPTGAGT
ATTTTGFPATGLNYQTTYEIYVRSDCGVDGFSEWAGPITFTTTAQLNFSVDCAVGPENLV
YCYEDNETNVFTFTSTDGSPLNFIINSGNVESCCDELVVYDTDGTELFNDTNGGNLSGLT
FQSTGDTISFTIASDGSVNCQGSSTINPIDVTVSCATCTNPTATYQVVDDCANGDQFLVD
VNITSLGDATSLSIEDNQGNPPVSVSATGVTSFGPYPFNTDIIFTVSNEQDVNCVITSPA
LQLAACPPVNDNCDGATVAAVNDSFLCEVSTPGTLTEATPSGVPNPSCGGDPDDDIWFQF
VATSEYQLIALANIQGSSTINIDHAVYEGTCGALTEISCTTGFSLLSSITPQLTIGNTYF
IRIFSNGSAAQTTTFDLCITPYEAPTNITCDLTENLCPGGDDLYTYNTVGVLPGFGSIDC
LGSSPNPTFSVIEIGTSGDIDIEMVQNTAFDSMGNPIGDELDVDFALWGPFNAGDDYCNG
GDYPSTPVTACSYSAAPVENFIINNAVAGDIYILLITNFEQDPGIIQINQTNLDPNNPDP
NAGTLSGEIEAEIISNDTVFIDEDNDETTPPVANLCGFDSIVLEVDSPFADTVEWYVNGI
LDPTLTTTSITVTESNSYTVTAYDNQCMGNDTSTVIVNLYQEPTVNTVPDEEVSITTCDD
ESGDGIEEFDFSSLSSIILDSPGQDPADFLVTYHETLSDAQSGANALTSPYSATDGTIIY
VRVEDVDSVGSGSGCASTNTTFELTVLGALPEISDLDDLELCDDESRDGTEFFDLEQNTP
AILNGQDPSVFVVSYHETQADADAGANPLTSPYANTSTPQTIYARIQNNAASDCYKTTTF
NLIVKDLPETTFDANVDYEVCPNATSPITITAIANNYTESEVTINWYYEGDLIAGQNDLT
LDTVLLAGDYEIEVTFSGDNTQCTSSQTVSVIELESCIIPQGISPNGDQKNDTFDLSSFD
VQSLTIFNRNGVKVYEKTNYTNEWHGQSLDGDELPVGTYYYVMNYQGNKTKAAWVYINRE
NK
NT seq 5409 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagaaaaactacacttttattagctggtatgctactgtttttagggcatatcgttaat
gcacaaattacaacttatccatactctgaagattttgaagcaggtgatggtggatgggta
gcagataatgcaactaatggcacatgggctttaggaacacctgcagcaacagttattaat
agtgctgcttctggagcaaattcatggacaacaaatttaacaggagaatataataattca
gaatcttcatctgttacaagtccagttttcgatttttcagctttattagcaccagcaata
acatttaatatttggtgggaatcagaatttagttgggatggaaccgtacttcaatcttca
atagatggcggaacaacatggcaaaatgttggcgcattaggagatgcaggtaactggtat
acagatggtacaataaatggaaatcctggaggtcagcaacaaggatggactgggcgtaat
ggatcaggatccaatggttgggttactgccagtcatgcattaacaggtttagcaggagaa
gctagtgtacaattacgttttgcatttggttcagacggttctgtaccagatgaaggagta
gcttttgatgatgttacagtattcgaagtaacatgtccagagccttcagcattaactttt
attagttcaacttctagtacagccaatttgtcttggactcctggaggaggagaaacagct
tgggaagttgttgtgcagccacaaggtacagggatacctacaggagctggtacaggaact
actttaaatacaggatatgaagaaacaggattaacaccagcgacaaattacgaagcttat
gtaagatcagattgtggtggagaatttagtatatgggttgggcctttaaattttgcaaca
gaatgtgtaacatttgtggcaccttatacagaaggtttcgaaaacggaggaacaattcct
ttatgttggtcaatggatggtggagaagattggcagtttaataccgcaggacctaaccat
gttggaaataatggaacacttacaggaacaacagttacaggtaactactacgcagtagta
gatgcttctggagacgatggagctataactcttacaacacctcttgtagatgtgtcgact
ttaacaactccagcaataactttttatgaaattagtgataatgaaggttttgcaaactct
caattagatgtagaggtttgggatggagccgcttggaatttaatggcaacatataacaca
aacacaagtggttgggaacaacgtacagttaatattagtactcttaatattactggagat
gtacaagcaagatttattttttctgaagtaataaattcaggagatttttatgatgatatc
gcaattgatgatgttactttcgatgagttaccatcatgtgtaaacccatcaaatttagct
gtagatagtgctacagatacaactgcaacattatcatgggtttctaacggtacagaaaca
gcttgggaagtagtagtacaagctcctggttctggagctccaactggagctggagatgca
gcagcaactaatccatatactgcaacaggattaactgcagcaacaacatacgaatattat
ataagagcagattgtggcggaggtgaatttagtgactggattggaccattaacttttgat
accgagtgtacaacttatatagcaccatatacagaaggatttgaaaacggaggagttatt
ccattatgttggtcaatggatggtggagaagattggcagtttaataccgcaggaccaaat
cacgtaggtgatggaggtactttatcaggagcaacagcaacaggtaattactatgcggtt
gtagacgcttcaggagatgatggagctataactcttacaacacctcttgtagatgtatct
actttaacaacaccagctctatctttctatgaaattagtgataatgaaggaaatgcaaac
tctcaattagatgtagaggtttgggatggtgccgcatggaacttaatgggtacatataat
acaaatactgtaggatgggaattaaaaataattgacataagtacattaacaattactgga
gatgttcaggcaagatttattttctctgaagtaatagcaccaggagatttttatgatgat
atcgctattgatgatgttacttttgatgaattaccaccatgtgttattccaggaggaata
gcagcaaataatatagcaggaacttcagccgatattacctggatggcaggtggaggagaa
actgcttgggagtatgtaatacaacctgcaggaactggagaaccaactggagctggaaca
gcaactactacaacaggatttccagctacaggtttaaattaccaaacaacttacgaaatt
tatgtaagatcagattgtggtgttgatggatttagtgaatgggcaggaccaattactttt
acaactactgcgcaacttaacttttcagtagactgtgcagtaggaccagaaaaccttgtt
tattgttatgaggataatgaaactaatgtatttacatttacaagtacagacggttctcct
ttaaactttattattaactctggaaatgtagaatcttgttgcgatgaattagtagtttat
gacactgatggaacagagctatttaacgataccaatggagggaatttaagtggtttaact
ttccaatctacaggagatactatctcatttacaatagcttcagacggatctgtaaattgt
caaggtagctcaactattaatccaatagacgtaacggtatcttgtgctacatgtacaaac
ccaactgcaacataccaagttgtagatgattgtgcaaatggagaccaatttttagtagat
gttaacattacttctttaggagacgctacatcactttcaatagaggataatcaaggaaat
ccaccagtttctgtttctgcaacaggtgtaacttcatttgggccatatccttttaataca
gatataatttttacagttagtaatgagcaagatgtaaattgtgtaattacaagtccagct
ttacaattagctgcttgtcctccagttaacgataattgtgatggagcaacagtagctgct
gtaaacgatagttttttatgtgaagttagtacaccaggaacattaacagaagctacacct
tctggagttccaaacccttcttgtggtggtgacccagatgatgatatttggtttcagttt
gttgctactagcgaataccaattaattgctttagcaaatattcaaggtagttcaacaatt
aatatagatcatgcagtctatgaaggaacttgtggtgcattaacagaaattagttgtaca
acaggattttcattactttctagtattacacctcaattaacaattggaaatacttatttt
attagaatattttctaatggtagtgccgcacaaacaacaacgttcgatttgtgtattaca
ccttacgaagcaccaacaaatataacatgtgaccttacagaaaacttatgtccaggtgga
gacgatttatatacttacaatacagtaggtgttcttccaggatttggttctatagactgt
ttagggtcttcgccaaacccaacttttagtgtaatcgaaatcggaacgtctggagatatt
gatatcgagatggttcagaatacagctttcgattctatgggtaacccaattggagatgag
ttagatgtagattttgcactttggggaccatttaatgcaggtgatgattattgtaatgga
ggagattacccatcaactccagtaacagcatgtagttattctgctgctccagtagaaaac
tttataattaacaatgccgttgcaggtgatatttatatcttgttaattacaaactttgag
caagatccaggaataattcaaattaatcaaactaatttagatcctaataatccagatcca
aatgctggaactttaagtggagaaatagaagcagaaattattagtaatgatactgttttt
atagatgaagataatgatgaaacaacacctcctgtagctaatctatgtggttttgattct
atcgttttagaagtagattctccttttgcagatactgtagaatggtatgttaatggaatt
ttagatcctactttaacaacaacatctataactgtaacagaatctaactcttatacagtt
acagcatatgataaccaatgtatgggtaacgatacaagtactgtaattgttaatctgtat
caagaaccaacagtaaacactgttccagatgaagaagtatcaattacaacttgtgatgat
gagtctggagatggtattgaagaattcgattttagttcattatctagtataattttagat
agtccaggacaagatccagcagactttttagtaacatatcatgaaactttaagcgatgct
caatcaggagcaaatgcattaacttcgccatattctgctacagatggaactattatatat
gttagagtagaagatgtagattctgtaggttctgggtctggttgtgcaagtactaatact
acttttgaattaacagtattaggagcacttcctgaaatttcagatttagatgatttagag
ttatgtgatgatgaatctagagatggtactgagttttttgatttagaacaaaatacacct
gcaatacttaatggtcaagatccatcagtatttgtggttagttatcatgagactcaggct
gatgctgatgctggtgcgaacccattaacttcgccttatgcaaatacatcaactcctcaa
acaatttatgctagaatacaaaataacgcagcatcagattgttacaagactacaactttt
aatttaatagttaaggatcttccagaaacaacatttgatgcaaatgtagattacgaagtt
tgccctaacgctacctctccaataactattactgcaatagctaataattatacagagagt
gaagttactataaattggtattatgaaggagatttaattgcgggacaaaacgatcttact
ttagatacagtacttttagctggtgattacgaaatagaagttacttttagcggagataat
acacaatgtacatcatctcaaacagtatctgtaatagaattagaatcatgtataattcca
caaggtatttcgccaaacggagaccagaagaatgacacgtttgatttaagtagtttcgat
gttcaaagcttaactatatttaatagaaatggagtaaaagtttacgagaagacgaattat
acaaacgagtggcatggtcaatcattagatggcgatgagttaccagtagggacatattac
tatgtaatgaactaccaaggtaataaaacaaaagccgcttgggtatatatcaatagagaa
aacaaataa

DBGET integrated database retrieval system