GenomeNet

Database: Pfam
Entry: APAF1_C
LinkDB: APAF1_C
Original site: APAF1_C 
#=GF ID   APAF1_C
#=GF AC   PF17908.2
#=GF DE   APAF-1 helical domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   ECOD:EUF01996
#=GF GA   22.80 22.80;
#=GF TC   22.80 22.80;
#=GF NC   22.70 22.70;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   15829969
#=GF RT   Structure of the apoptotic protease-activating factor 1 bound to
#=GF RT   ADP.
#=GF RA   Riedl SJ, Li W, Chao Y, Schwarzenbacher R, Shi Y;
#=GF RL   Nature. 2005;434:926-933.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   23521171
#=GF RT   Changes in Apaf-1 conformation that drive apoptosome assembly.
#=GF RA   Yuan S, Topf M, Reubold TF, Eschenburg S, Akey CW;
#=GF RL   Biochemistry. 2013;52:2319-2327.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   21827944
#=GF RT   Crystal structure of full-length Apaf-1: how the death signal is
#=GF RT   relayed in the mitochondrial pathway of apoptosis.
#=GF RA   Reubold TF, Wohlgemuth S, Eschenburg S;
#=GF RL   Structure. 2011;19:1074-1083.
#=GF DR   INTERPRO; IPR041452;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This domain represents the C-terminal alpha helical domain of
#=GF CC   the apoptotic Apaf-1 protein.
#=GF SQ   620
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#=GS A0A3Q2IBG3_HORSE/387-528    AC A0A3Q2IBG3.1
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#=GS A0A2Y9RAP5_TRIMA/453-502    AC A0A2Y9RAP5.1
#=GS A0A1H1FXC6_9ACTN/418-507    AC A0A1H1FXC6.1
#=GS B3RMQ0_TRIAD/76-204         AC B3RMQ0.1
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#=GS A0A091V063_NIPNI/453-587    AC A0A091V063.1
#=GS A0A3D9SX47_9ACTN/510-590    AC A0A3D9SX47.1
#=GS A0A2K5KG92_COLAP/453-587    AC A0A2K5KG92.1
#=GS B4QIJ2_DROSI/436-583        AC B4QIJ2.1
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#=GS M3YJ50_MUSPF/454-588        AC M3YJ50.1
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#=GS B3RMQ9_TRIAD/934-1062       AC B3RMQ9.1
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#=GS U3ISE8_ANAPP/452-586        AC U3ISE8.2
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#=GS D3BB26_POLPP/704-849        AC D3BB26.1
#=GS A0A2D0HBX1_9NOSO/478-532    AC A0A2D0HBX1.1
#=GS B7PB18_IXOSC/446-577        AC B7PB18.1
#=GS W5NDE7_LEPOC/455-589        AC W5NDE7.1
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#=GS A0A2K8SFR0_9NOSO/244-296    AC A0A2K8SFR0.1
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#=GS A0A077ZNT3_TRITR/115-219    AC A0A077ZNT3.1
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#=GS B3SCE4_TRIAD/337-459        AC B3SCE4.1
#=GS A0A2K5S7U0_CEBCA/409-543    AC A0A2K5S7U0.1
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#=GS E2B006_CAMFO/455-591        AC E2B006.1
#=GS A0A0L7QS16_9HYME/327-466    AC A0A0L7QS16.1
#=GS A0A2K5NTR1_CERAT/453-587    AC A0A2K5NTR1.1
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#=GS A0A1A6GSX0_NEOLE/229-353    AC A0A1A6GSX0.1
#=GS A0A3Q3A889_KRYMA/455-589    AC A0A3Q3A889.1
#=GS A0A337S9X3_FELCA/454-588    AC A0A337S9X3.1
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#=GS A0A0V7ZYH1_9CYAN/326-379    AC A0A0V7ZYH1.1
#=GS A0A1Q4RIK5_9CYAN/2-100      AC A0A1Q4RIK5.1
#=GS A0A0K1JPG2_9MICO/417-527    AC A0A0K1JPG2.1
#=GS A0A452S0E8_URSAM/396-530    AC A0A452S0E8.1
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