KEGG   Viruses: 37627015
Entry
37627015          CDS       T40000                                 
Symbol
S, D1Y29_gp2
Name
(RefSeq) Porcine coronavirus HKU15; spike glycoprotein
  KO
K19254  Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1159905  Porcine coronavirus HKU15
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 CoV_S1 CoV_S1_C CoV_S2_C DUF2959 GP41 Phage_GPO Syntaxin-6_N DUF16 Filament
Other DBs
NCBI-GeneID: 37627015
NCBI-ProteinID: YP_009513021
RS: NC_039208
Position
NC_039208:19317..22796
AA seq 1159 aa
MQRALLIMTLLCLVRAKFADDLLDLLTFPGAHRFLHKLTSNSSSLYSRANNFDVGVLPGY
PTKNVNLFSPLTNSTLPINGLHRSYQPLMLNCLTKITNHTLSMYLQPSEIQTYSCGGAMV
KYQTHDAVRIILDLTATDHISVEVVGQHGENYVFVCSEQFNYTTALHNSTFFSLNSELYC
FTNNTYLGILPPDLTDFTVYRTGQFYANGYLLGTLPITVNYVRLYRGHLAANSAHFALAN
LTDTLITLTNTTISQITYCDKSVVDSIACQRSSHEVEDGFYSDPKSAVRARQRTIVTLPK
LPELEVVQLNISAHMDFGEARLDSVTINGNTSYCVTKPYFRLETNFMCTGCTMNLRTDTC
SFDLSAVNNGMSFSQFCLSTESGACEMKIIVTYVWNYLLRQRLYVTAVEGQTHTGTTSVH
ATDTSSVITDVCTDYTIYGVSGTGIIKPSDLLLHNGIAFTSPTGELYAFKNITTGKTLQV
LPCETPSQLIVINNTVVGAITSSNSTENNRFTTTIVTPTFFYSTNATTFNCTKPVLSYGP
ISVCSDGAIAGTSTLQNTRPSIVSLYDGEVEIPSAFSLSVQTEYLQVQSEQVIVDCPQYV
CNGNSRCLQLLAQYTSACSNIEAALHSSAQLDSREIINMFQTSTQSLQLANITNFKGDYN
FSSILTTRLGGRSAIEDLLFNKVVTSGLGTVDQDYKACSRDMAIADLVCSQYYNGIMVLP
GVVDAEKMAMYTGSLTGAMVFGGLTAAAAIPFATAVQARLNYVALQTNVLQENQKILAES
FNQAVGNISLALSSVNDAIQQTSEALNTVAIAIKKIQTVVNQQGEALSHLTAQLSNNFQA
ISTSIQDIYNRLEEVEANQQVDRLITGRLAALNAYVTQLLNQMSQVRQSRLLAQQKINEC
VKSQSSRYGFCGNGTHIFSLTQTAPNGIFFMHAVLVPNKFTRVNASAGICVDNTRGYSLQ
PQLILYQFNNSWRVTPRNMYEPRLPRQADFIQLTDCSVTFYNTTAANLPNIIPDVIDVNQ
TVSDIIDNLPTATPPQWDVGIYNNTILNLTVEINDLQERSKNLSQIADRLQNYIDNLNNT
LVDLEWLNRVETYLKWPWYIWLAIALALIAFVTILITIFLCTGCCGGCFGCCGGCFGLFS
KKKRSTDDQPTPSFKFKEW
NT seq 3480 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcagagagctctattgattatgaccttactttgtctcgttcgagcaaagtttgctgat
gatctactcgatttgctcaccttcccgggtgcacatcgcttcttacataaactcacgagt
aattccagcagtctctactcgcgggctaataattttgatgttggcgttcttcctggctac
cccactaagaacgttaacctcttctcaccacttactaactccactttgcccattaatggc
cttcatcggagttatcaaccactcatgctgaattgtcttactaaaataactaaccacact
ctcagcatgtatctccaacctagtgagatacaaacctatagctgcggcggtgccatggtt
aaataccagacacatgatgcagttcgtatcattttagacctcactgccactgaccacatc
tctgttgaagtcgttggccagcatggtgaaaattatgtgtttgtttgtagtgagcagttt
aactataccactgcattacacaactctaccttcttctcacttaattctgagctttattgc
tttactaataacacctacttaggtattcttccacctgatttaactgactttacggtctat
cgtactggtcagttctatgctaatggttaccttttaggtactttacctattacggttaac
tatgttaggttgtatcggggtcacttggcggccaatagtgcccactttgcccttgcaaac
ctaaccgatacactcataacacttaccaatactactatatcgcaaatcacttattgtgat
aagtcagtagttgattcaatagcatgccagcgctcttctcacgaagtggaggatgggttt
tactctgaccctaaatctgccgttagagctaggcaacgtactattgttacactacctaag
ctccctgagcttgaagtagtgcagttaaatatttctgcacacatggattttggcgaagcc
agacttgacagcgttaccatcaatggtaacacatcctattgtgtcactaagccttacttc
aggcttgaaactaactttatgtgtacaggttgcactatgaatctgcgcactgatacctgt
agttttgacctgtcagcagtaaacaatggcatgtcattctctcaattctgtctaagcact
gaatctggtgcttgtgagatgaaaattattgttacctacgtatggaattacttgctaagg
cagcgtttgtatgttacagctgtagagggccagactcacactggaaccacttcagtacat
gcaacagacacttctagtgtaatcactgatgtctgcactgactacactatctatggagtc
tctggcactggcattattaagccatcagatctcttattgcacaatggcatagcattcacc
tctccaacaggtgagctttatgcatttaaaaatataaccactggcaaaacccttcaggtc
ttaccgtgtgaaaccccttctcaactgattgtgataaacaacaccgttgtcggtgctatc
acatccagtaattcaactgaaaataataggtttactactactattgtcacacctactttc
ttttattccacaaatgccaccaccttcaactgcaccaagcctgttttgtcctatggaccc
atcagcgtgtgtagtgatggtgcaattgcgggaacatccacattacagaatactcgacca
tccatagtttcactatacgatggcgaagttgaaataccatctgcattttctctttctgtt
cagacggagtatttgcaagttcaatcagagcaagttatagttgattgtcctcagtatgta
tgcaatggcaacagccggtgtctacaattactggcacaatacacctcagcttgctctaac
attgaagcagctctgcattcctctgcacagttggatagcagagagattataaatatgttt
caaacatcaacacagtccttgcagttggctaatattaccaacttcaagggtgactacaat
tttagcagcatactaaccaccagacttggtggcagatctgctattgaagaccttcttttt
aataaagttgttactagtggccttggcactgttgatcaggactacaaagcctgctctaga
gacatggccatcgctgacttagtttgttcccagtattacaatggcatcatggttctacct
ggtgttgttgatgctgagaaaatggcaatgtatactggctctcttactggagctatggta
tttgggggactgactgctgcagcggcaataccattcgccacggcagtacaagcccgcctt
aattatgtcgcactgcaaacaaatgtactacaagaaaaccagaaaattcttgcagaatca
tttaaccaagcagttggcaatatatcacttgcactatcttctgttaatgatgccatccag
caaacttctgaggctcttaacaccgtagctattgctattaaaaagattcaaacagttgtt
aaccagcagggtgaggcattatcacacctgactgcacagctgtcaaacaattttcaagca
atttcgacttctattcaagacatttacaaccgtcttgaggaagtagaggctaaccagcaa
gttgaccgtctcatcacaggacggttggctgcacttaatgcatatgttactcagttactc
aatcagatgtctcaggttagacaatctcgattgctagctcagcaaaagattaatgagtgt
gtcaaatctcagtcgtccagatacggtttctgtggaaatggcacacacatcttctcactt
acacagactgcaccaaatggcatatttttcatgcatgcagtgcttgtacccaacaaattc
acacgtgtcaacgcttctgccggcatttgtgtggataataccagaggctactcattgcag
cctcaacttatactctaccagtttaataactcctggagagttacacctagaaatatgtat
gaacccagactgccccggcaagctgatttcatacaattaactgattgcagcgttactttt
tataacaccaccgctgctaatcttcccaatattattcctgacgttatagatgtcaatcaa
acagtcagtgatattattgacaatttacctacagcaacacctcctcagtgggatgttggt
atctataacaacactattctcaaccttaccgttgagattaatgatctacaagagcggtct
aaaaacctctcacagattgcagatcgtttacaaaattatattgataatcttaacaatact
ctagttgaccttgaatggctcaacagagtggaaacttaccttaaatggccgtggtatata
tggcttgccattgccctggctcttattgcatttgtgacaatcctcataacaatctttctt
tgtactggttgttgtggtggttgctttggttgttgtggcggttgttttggccttttctct
aagaagaaaaggtctaccgacgaccaaccaacaccgtcctttaagtttaaggaatggtag

DBGET integrated database retrieval system