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Virus (species) name
Virus lineage
Host name
Host lineage
Alpaca respiratory coronavirus [TAX:1176035] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; Duvinacovirus;
Human coronavirus 229E		 Felis catus [TAX:9685] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Carnivora;
Feliformia; Felidae; Felinae;
Felis
Vicugna pacos [TAX:30538] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Artiodactyla;
Tylopoda; Camelidae; Vicugna
Alphacoronavirus Bat-CoV/P.kuhlii/Italy/3398-19/2015 [TAX:2492658] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; Nyctacovirus;
Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398		 Pipistrellus kuhlii [TAX:59472] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Pipistrellus
Alphacoronavirus sp. [TAX:1906673] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus		 Eptesicus regulus [TAX:138978] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Eptesicus
Ozimops [TAX:2689069] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Molossidae
Avian infectious bronchitis virus partridge/GD/S14/2003 [TAX:284515] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Gammacoronavirus; Igacovirus; Avian coronavirus;
Infectious bronchitis virus		 Gallus gallus [TAX:9031] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Sauropsida; Sauria;
Archelosauria; Archosauria; Dinosauria; Saurischia;
Theropoda; Coelurosauria; Aves; Neognathae;
Galloanserae; Galliformes; Phasianidae;
Phasianinae; Gallus
Bat alphacoronavirus [TAX:2419667] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; unclassified Alphacoronavirus		 Desmodus rotundus [TAX:9430] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Phyllostomidae; Desmodontinae;
Desmodus
Myotis daubentonii [TAX:98922] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Myotis
Bat coronavirus [TAX:1508220] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Coronavirinae;
unclassified Coronavirinae		 root [TAX:1] This viral genome is acquired from environmental sample(s).
Organismal (Epomophorus gambianus [TAX:372077])
Bat coronavirus (BtCoV/133/2005) [TAX:389230] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Tylonycteris bat coronavirus HKU4		 Tylonycteris pachypus [TAX:258959] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Tylonycteris
Bat coronavirus 1A [TAX:393767] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; Minunacovirus;
Miniopterus bat coronavirus 1		 Miniopterus magnater [TAX:438766] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Miniopteridae;
Miniopterus
Bat coronavirus 1B [TAX:393768] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; Minunacovirus;
Miniopterus bat coronavirus 1		 Miniopterus pusillus [TAX:258934] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Miniopteridae;
Miniopterus
Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008 [TAX:864596] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Sarbecovirus; unclassified Sarbecovirus		 Rhinolophus blasii [TAX:519037] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yinpterochiroptera; Rhinolophoidea; Rhinolophidae;
Rhinolophinae; Rhinolophus
Bat coronavirus CDPHE15/USA/2006 [TAX:1384461] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae;
Alphacoronavirus; Colacovirus;
Bat coronavirus CDPHE15		 Myotis lucifugus [TAX:59463] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Myotis
Bat coronavirus Cp/Yunnan2011 [TAX:1283333] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Sarbecovirus; Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus		 Mops [TAX:258862] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Molossidae
Mops plicatus [TAX:3370289] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Molossidae;
Mops
Bat coronavirus HKU4-2 [TAX:424360] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Tylonycteris bat coronavirus HKU4		 Tylonycteris pachypus [TAX:258959] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Tylonycteris
Bat coronavirus HKU4-3 [TAX:424361] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Tylonycteris bat coronavirus HKU4		 Tylonycteris pachypus [TAX:258959] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Tylonycteris
Bat coronavirus HKU4-4 [TAX:424362] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Tylonycteris bat coronavirus HKU4		 Tylonycteris pachypus [TAX:258959] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Tylonycteris
Bat coronavirus HKU5-2 [TAX:424364] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Pipistrellus bat coronavirus HKU5		 Pipistrellus abramus [TAX:105295] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Pipistrellus
Bat coronavirus HKU5-3 [TAX:424365] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Pipistrellus bat coronavirus HKU5		 Pipistrellus abramus [TAX:105295] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Pipistrellus
Bat coronavirus HKU5-5 [TAX:424366] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Merbecovirus; Pipistrellus bat coronavirus HKU5		 Pipistrellus abramus [TAX:105295] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yangochiroptera; Vespertilionidae;
Pipistrellus
Bat coronavirus HKU9-10-1 [TAX:875612] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Nobecovirus; Rousettus bat coronavirus HKU9		 Rousettus leschenaultii [TAX:9408] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yinpterochiroptera; Pteropodoidea; Pteropodidae;
Rousettinae; Rousettus
Bat coronavirus HKU9-10-2 [TAX:875613] Viruses; Riboviria; Orthornavirae; Pisuviricota;
Pisoniviricetes; Nidovirales; Cornidovirineae;
Coronaviridae; Orthocoronavirinae; Betacoronavirus;
Nobecovirus; Rousettus bat coronavirus HKU9		 Rousettus leschenaultii [TAX:9408] Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa;
Bilateria; Deuterostomia; Chordata; Craniata;
Vertebrata; Gnathostomata; Teleostomi;
Euteleostomi; Sarcopterygii; Dipnotetrapodomorpha;
Tetrapoda; Amniota; Mammalia; Theria; Eutheria;
Boreoeutheria; Laurasiatheria; Chiroptera;
Yinpterochiroptera; Pteropodoidea; Pteropodidae;
Rousettinae; Rousettus
Laboratory of Chemical Life Science | Kyoto University Bioinfomatics Center | Institute for Chemical Research