KEGG   ORTHOLOGY: K03087
Entry
K03087                      KO                                     

Name
rpoS
Definition
RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
Pathway
ko02026  Biofilm formation - Escherichia coli
ko05111  Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
    K03087  rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
   02026 Biofilm formation - Escherichia coli
    K03087  rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery
    K03087  rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
Transcription machinery [BR:ko03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     K03087  rpoS; RNA polymerase nonessential primary-like sigma factor
Other DBs
COG: COG0568
GO: 0016987
Genes
ECO: b2741(rpoS)
ECJ: JW5437(rpoS)
ECD: ECDH10B_2909(rpoS)
EBW: BWG_2477(rpoS)
ECOK: ECMDS42_2246(rpoS)
ECE: Z4049(rpoS)
ECS: ECs3595
ECF: ECH74115_3992(rpoS)
ETW: ECSP_3689(rpoS)
ELX: CDCO157_3355
EOI: ECO111_3465(rpoS)
EOJ: ECO26_3810(rpoS)
EOH: ECO103_3283(rpoS)
ECOO: ECRM13514_3592(rpoS)
ECOH: ECRM13516_3458(rpoS)
ESL: O3K_05825
ESO: O3O_19820
ESM: O3M_05870
ECK: EC55989_3012(rpoS)
EOK: G2583_3389(rpoS)
ELH: ETEC_2932
ECW: EcE24377A_3042(rpoS)
EUN: UMNK88_3415(rpoS)
ECP: ECP_2722
ECOS: EC958_3012(rpoS)
ECV: APECO1_3782(rpoS)
ECX: EcHS_A2879(rpoS)
ECM: EcSMS35_2866(rpoS)
ECY: ECSE_2993
ECQ: ECED1_3196(rpoS)
EUM: ECUMN_3064(rpoS)
ECT: ECIAI39_2929(rpoS)
EOC: CE10_3166(rpoS)
EBR: ECB_02591(rpoS)
EBL: ECD_02591(rpoS)
EBE: B21_02556(rpoS)
EBD: ECBD_0983
ECI: UTI89_C3111(rpoS)
ECZ: ECS88_3010(rpoS)
ECC: c3306 c3307
ELO: EC042_2935(rpoS)
ESE: ECSF_2537
EKF: KO11_09270(rpoS)
EAB: ECABU_c30160(rpoS)
EDJ: ECDH1ME8569_2651(rpoS)
ELW: ECW_m2947(rpoS)
ELL: WFL_14390(rpoS)
ELC: i14_3034
ELD: i02_3034
ELP: P12B_c2844(rpoS)
ELF: LF82_1965(rpoS)
ECOI: ECOPMV1_03001(rpoS)
ECOJ: P423_15025
EFE: EFER_0328(rpoS)
EAL: EAKF1_ch3253(rpoS)
ESZ: FEM44_03595(rpoS)
STY: STY3049(rpoS)
STT: t2825(rpoS)
STM: STM2924(rpoS)
SEO: STM14_3526(rpoS)
SEY: SL1344_2903(rpoS)
SEJ: STMUK_2913(rpoS)
SEB: STM474_3064(rpoS)
SEF: UMN798_3172(rpoS)
SEND: DT104_29221(rpoS)
SENI: CY43_15260
SPT: SPA2780(rpoS)
SEK: SSPA2592
SEI: SPC_2966(rpoS)
SEC: SCH_2856(rpoS)
SEH: SeHA_C3113(rpoS)
SEE: SNSL254_A3129(rpoS)
SEW: SeSA_A3074(rpoS)
SENS: Q786_14090
SED: SeD_A3233(rpoS)
SEG: SG2827(rpoS)
SEL: SPUL_2922(rpoS)
SET: SEN2763(rpoS)
SENA: AU38_14035
SENO: AU37_14045
SENV: AU39_14045
SENQ: AU40_15800
SENL: IY59_14640
SEEP: I137_13920
SENE: IA1_14010
SBG: SBG_2538(rpoS)
SBZ: A464_2942
SALZ: EOS98_04875(rpoS)
SFL: SF2764
SFV: SFV_2757(rpoS)
SFE: SFxv_3031(rpoS)
SFN: SFy_3933
SFS: SFyv_4010
SFT: NCTC1_03042(rpoS)
SSN: SSON_2889(rpoS)
SBO: SBO_2779(rpoS)
SDY: SDY_2940(rpoS)
ENC: ECL_04088
ECLX: LI66_17810
ECLY: LI62_19270
ECLZ: LI64_16720
ECLO: ENC_29950
EEC: EcWSU1_03562(rpoS)
ECHG: FY206_19495(rpoS)
ENF: AKI40_0972(rpoS)
EBG: FAI37_11395(rpoS)
CSK: ES15_0809(rpoS)
CTU: CTU_33130(rpoS)
KPN: KPN_03103(rpoS)
KPU: KP1_4373(rpoS)
KPP: A79E_0995
KPT: VK055_4413(rpoS)
KPR: KPR_4100(rpoS)
KPJ: N559_1131
KPX: PMK1_00584(rpoS)
KPNU: LI86_05580
KPNK: BN49_1023(rpoS)
KVA: Kvar_0962
KPE: KPK_1020(rpoS)
KOX: KOX_01030
KOE: A225_4656
EAE: EAE_01845
EAR: CCG33624
KLW: DA718_05960(rpoS)
CRO: ROD_30681(rpoS)
CKO: CKO_04101
CPOT: FOB25_16405(rpoS)
CAMA: F384_14925
HDE: HDEF_1712(rpoS)
EBT: EBL_c08730(rpoS)
RTG: NCTC13098_01443(rpoS)
REE: electrica_00956(rpoS)
CLAP: NCTC11466_00754(rpoS)
KOT: EH164_04205(rpoS)
KPSE: IP581_18440(rpoS)
KIE: NCTC12125_04945(rpoS)
KAS: KATP_09470(rpoS)
ICP: ICMP_121(rpoS)
LER: GNG29_18210(rpoS)
LEA: GNG26_17615(rpoS)
LNI: CWR52_17275(rpoS)
BUF: D8682_20430(rpoS)
BAGE: BADSM9389_09300(rpoS)
METY: MRY16398_10590(rpoS)
AHN: NCTC12129_03942(rpoS)
YRE: HEC60_13395(rpoS)
SGOE: A8O29_005095(rpoS)
PDZ: HHA33_07475(rpoS)
EBF: D782_0955
PSTS: E05_45280
YPE: YPO3355(appR)
YPK: y0834(rpoS)
YPH: YPC_3674(rpoS)
YPA: YPA_2788
YPN: YPN_0738
YPM: YP_0332(rpoS)
YPG: YpAngola_A0958(rpoS)
YPZ: YPZ3_2954(rpoS)
YPD: YPD4_2940(rpoS)
YPX: YPD8_2938(rpoS)
YPW: CH59_2694(rpoS)
YPJ: CH55_1934(rpoS)
YPV: BZ15_168(rpoS)
YPL: CH46_1740(rpoS)
YPS: YPTB0776(rpoS)
YPO: BZ17_1780(rpoS)
YPI: YpsIP31758_3293(rpoS)
YPY: YPK_3425
YPB: YPTS_0810
YPQ: DJ40_1596(rpoS)
YPU: BZ21_4159(rpoS)
YPR: BZ20_1309(rpoS)
YPC: BZ23_252(rpoS)
YPF: BZ19_125(rpoS)
YEN: YE0775(appR)
YEY: Y11_22741
YEW: CH47_2713(rpoS)
YET: CH48_2482(rpoS)
YEE: YE5303_25641(appR)
YAL: AT01_3301(rpoS)
YFR: AW19_4110(rpoS)
YIN: CH53_924(rpoS)
YKR: CH54_1680(rpoS)
YRO: CH64_3389(rpoS)
YRU: BD65_2641(rpoS)
YHI: D5F51_04710(rpoS)
YCA: F0T03_04435(rpoS)
YMO: HRD69_09650(rpoS)
SMAC: SMDB11_0142(rpoS)
SMW: SMWW4_v1c08110(rpoS)
SPE: Spro_0832
SRL: SOD_c06950(rpoS)
SPLY: Q5A_003645(rpoS)
SMAF: D781_0786
SERF: L085_00200
SQU: E4343_12395(rpoS)
SFJ: SAMEA4384070_0860(rpoS)
SOF: NCTC11214_00668(rpoS)
RAA: Q7S_03165
EAME: GXP68_16940(rpoS)
RBAD: H2866_11680(rpoS)
ECA: ECA3530(rpoS)
PATR: EV46_17510
PATO: GZ59_35510(rpoS)
PCT: PC1_3348
PEC: W5S_3646
PPUJ: E2566_16880(rpoS)
DDD: Dda3937_03911(rpoS)
DDQ: DDI_3263
DAQ: DAQ1742_03524(rpoS)
DIC: Dpoa569_000806(rpoS)
BRB: EH207_13465(rpoS)
BNG: EH206_04465(rpoS)
LPOP: I6N93_03115(rpoS)
SOD: Sant_3242(rpoS)
PES: SOPEG_1031(rpoS)
EAM: EAMY_0765(rpoS)
EAY: EAM_2679(rpoS)
ETA: ETA_26950(rpoS)
EPY: EpC_28160(rpoS)
EBI: EbC_35220(rpoS)
ERJ: EJP617_19210(rpoS)
EGE: EM595_2799(rpoS)
ERWI: GN242_04370(rpoS)
PAM: PANA_3042(rpoS)
PLF: PANA5342_0993(rpoS)
PAJ: PAJ_2317(rpoS)
PVA: Pvag_2436(rpoS)
HHS: HHS_01790
PSTW: DSJ_05310
PANS: FCN45_14885(rpoS)
PEY: EE896_04320(rpoS)
PDIS: D8B20_13510(rpoS)
MINT: C7M51_02519(rpoS)
MTHI: C7M52_00336(rpoS)
TPTY: NCTC11468_00926(rpoS)
PLU: plu0719(rpoS)
PAY: PAU_00692(rpoS)
PMR: PMI2236(rpoS)
PMIB: BB2000_2367(rpoS)
PHAU: PH4a_03410
PCIB: F9282_15035(rpoS)
PCOL: F1325_14595(rpoS)
XBO: XBJ1_3581(rpoS)
XBV: XBW1_4037(rpoS)
XNE: XNC1_3846(rpoS)
XNM: XNC2_3699(rpoS)
XDO: XDD1_3158(rpoS)
XPO: XPG1_2762(rpoS)
PSI: S70_05600
PSX: DR96_225(rpoS)
PRG: RB151_034850(rpoS)
PHEI: NCTC12003_00956(rpoS)
PRQ: CYG50_21065(rpoS)
PRJ: NCTC6933_03094(rpoS)
PVC: G3341_04650(rpoS)
MMK: MU9_976
ANS: ArsFIN_37390(rpoS)
ETR: ETAE_2873(rpoS)
ETD: ETAF_2609(rpoS)
ETE: ETEE_1096(rpoS)
PRAG: EKN56_12220(rpoS)
LRI: NCTC12151_01117(rpoS)
PSHI: SAMEA2665130_2340(rpoS)
DKO: I596_2095
VCH: VC0534
VCS: MS6_0360
VCE: Vch1786_I2840(rpoS)
VCI: O3Y_02525
VCO: VC0395_A0062(rpoS)
VCR: VC395_0551(rpoS)
VCM: VCM66_0492(rpoS)
VCX: VAA049_3160(rpoS)
VCZ: VAB027_3315(rpoS)
VVU: VV1_1588(rpoS)
VVY: VV2808
VPA: VP2553
VPB: VPBB_2377
VNI: VIBNI_A0137(rpoS)
VAN: VAA_00696
VAU: VANGNB10_cI0440(rpoS)
VTA: A0092(rpoS)
VAF: D1115_02800(rpoS)
VAQ: FIV01_12435(rpoS)
VFI: VF_2067(rpoS) VF_A1015(rpoQ)
VSA: VSAL_I2506(rpoS) VSAL_II0319(rpoS)
AWD: AWOD_II_1179(rpoS) AWOD_I_2147(rpoS)
PPR: PBPRA3071(VV11588) PBPRB0960(PLU0719)
SALY: E8E00_10675(rpoS)
SCOT: HBA18_03005(rpoS)
PAE: PA3622(rpoS)
PAEV: N297_3746(rpoS)
PAEI: N296_3746(rpoS)
PAU: PA14_17480(rpoS)
PAP: PSPA7_1517(rpoS)
PAG: PLES_14131(rpoS)
PAF: PAM18_1324(rpoS)
PNC: NCGM2_4753(rpoS)
PAEB: NCGM1900_2654(rpoS)
PAEP: PA1S_07300
PAEM: U769_06780
PAEL: T223_07015
PAEU: BN889_04010(rpoS)
PAEG: AI22_26605
PAEC: M802_3743(rpoS)
PAEO: M801_3611(rpoS)
PMY: Pmen_3020
PMK: MDS_3297
PRE: PCA10_45030(rpoS)
PPSE: BN5_2801(rpoS)
PCQ: PcP3B5_47380(rpoS)
PPU: PP_1623(rpoS)
PPF: Pput_4154
PPT: PPS_1217
PPB: PPUBIRD1_3992(rpoS)
PPI: YSA_02526
PPX: T1E_4974(rpoS)
PPUH: B479_06165
PPUT: L483_05695
PPUN: PP4_41450(rpoS)
PMON: X969_04260
PMOT: X970_04235
PST: PSPTO_1565(rpoS)
PSB: Psyr_1374
PSYR: N018_18835
PSP: PSPPH_3809(rpoS)
PVD: CFBP1590__4014(rpoS)
PFL: PFL_1207(rpoS)
PPRC: PFLCHA0_c12280(rpoS)
PPRO: PPC_1246
PFO: Pfl01_1132(rpoS)
PFS: PFLU_1302(rpoS)
PFE: PSF113_1164(rpoS)
PFB: VO64_4463
PMAN: OU5_2266
PFW: PF1751_v1c12480(rpoS)
PEN: PSEEN4189(rpoS)
PSA: PST_1572(rpoS)
PSZ: PSTAB_1478(rpoS)
PSR: PSTAA_1597(rpoS)
PSTT: CH92_06530
PLUL: FOB45_19945(rpoS)
PPUU: PputUW4_01119(rpoS)
PKC: PKB_1250(rpoS)
PSES: PSCI_3184
PSEM: TO66_06050
PSEC: CCOS191_1147(rpoS)
PSOS: POS17_1212
PANR: A7J50_1438
PSET: THL1_4539
PSIL: PMA3_04975
PALL: UYA_16000
PUM: HGP31_06085(rpoS)
POJ: PtoMrB4_43300(rpoS)
PPSH: G5J76_21500(rpoS)
AVN: Avin_38680(rpoS)
AVL: AvCA_38680(rpoS)
AVD: AvCA6_38680(rpoS)
ACX: Achr_11690(rpoS)
PAGR: E2H98_03695(rpoS)
SON: SO_3432(rpoS)
SDN: Sden_1204
SFR: Sfri_1060
SAZ: Sama_1044
SBL: Sbal_3119
SLO: Shew_1213
SSE: Ssed_1298
SPL: Spea_1193
SHL: Shal_1230
SWD: Swoo_3342
SWP: swp_1364
SVO: SVI_3167(rpoS)
SPSW: Sps_04099
SLJ: EGC82_06975(rpoS)
SMAI: EXU30_05150(rpoS)
SPOL: FH971_14780(rpoS)
SBK: SHEWBE_3831(rpoS)
SKH: STH12_00583(rpoS)
SAES: HBH39_04425(rpoS)
ILO: IL0745(rpoS)
CPS: CPS_1079(rpoS)
COV: EKO29_14810(rpoS)
LSD: EMK97_06895(rpoS)
THT: E2K93_12170(rpoS)
THAP: FNC98_11960(rpoS)
PHA: PSHAa0691(rpoS)
PTN: PTRA_a0776(rpoS)
PAT: Patl_3864
PSM: PSM_A2370(rpoS)
PSEO: OM33_06145
PEA: PESP_a3001(rpoS)
PSPO: PSPO_a0644(rpoS)
PART: PARC_a3048(rpoS)
PTU: PTUN_a3373(rpoS)
PNG: PNIG_a0837(rpoS)
PTD: PTET_a2678(rpoS)
PSEN: PNC201_03295(rpoS)
PDJ: D0907_03570(rpoS)
PAGA: PAGA_a0882(rpoS)
MHC: MARHY0147 MARHY2358(rpoS)
MBS: MRBBS_1441(rpoS)
MARA: D0851_19850(rpoS)
MARJ: MARI_07150(rpoS_1) MARI_26720(rpoS_2)
AMAE: I876_03080
AMAO: I634_03185
AMAD: I636_02970
AMAI: I635_02950
AMAG: I533_02850
AMAC: MASE_02380
AAUS: EP12_03035
ALR: DS731_03360(rpoS)
APEL: CA267_006310(rpoS)
GNI: GNIT_2922(rpoS)
GPS: C427_4958
SALM: D0Y50_02345(rpoS)
SALK: FBQ74_14790(rpoS)
PIN: Ping_0677(rpoS)
FBL: Fbal_0853
MVS: MVIS_0443(rpoS) MVIS_0817(rpoS) MVIS_0995(rpoS) MVIS_1516(rpoS) MVIS_1804(rpoS)
CJA: CJA_2218(rpoS)
CEK: D0B88_11985(rpoS)
CEG: D0C16_07025(rpoS)
SDE: Sde_1253
TTU: TERTU_2830(rpoS)
SAGA: M5M_04900
MICC: AUP74_02042(rpoS)
MICT: FIU95_14850(rpoS2)
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BTE: BTH_I2226
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BTHA: DR62_3010
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BCT: GEM_1606
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BCON: NL30_13730
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BLAT: WK25_08805
BTEI: WS51_19500
BSEM: WJ12_09125
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BMEC: WJ16_09330
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BGO: BM43_3615(rpoS)
BYI: BYI23_A015530(rpoS)
BUK: MYA_1611
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BXE: Bxe_A2350
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BPH: Bphy_0962
BFN: OI25_3385(rpoS)
PMEG: FNZ07_22295(rpoS)
PPNO: DA70_06415
PPNM: LV28_24285
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PAPI: SG18_17325
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PLG: NCTC10937_01498(rpoS)
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MMS: mma_2134(rpoS)
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HSE: Hsero_2959(rpoS)
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CFU: CFU_1909(rpoS)
CARE: LT85_2712(rpoS)
CPRA: CPter91_2474(rpoS)
MALI: EYF70_06065(rpoS)
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RGE: RGE_33330(rpoS)
METR: BSY238_3114(rpoS)
DOE: DENOEST_1309(rpoS)
TBD: Tbd_0838
SDR: SCD_n01090(rpoS) SCD_n01120(rpoS)
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DSU: Dsui_1971
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AOA: dqs_1200
AZA: AZKH_3526(rpoS)
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TCL: Tchl_2076
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MTUE: J114_14460
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MTUT: HKBT1_2853(sigB)
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MBO: BQ2027_MB2729(sigB)
MBB: BCG_2723(sigB)
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MMIC: RN08_2995
MCE: MCAN_27361(sigB)
MCQ: BN44_60164(sigB)
MCV: BN43_40385(sigB)
MCX: BN42_40686(sigB)
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MAVI: RC58_04845
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MAV: MAV_3603
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MYO: OEM_34740
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MJD: JDM601_2452(sigB)
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MMIN: MMIN_01590(sigB)
MHIB: MHIB_19020(sigB)
ASD: AS9A_1756(sigB)
MKR: MKOR_15230(sigB)
CGL: NCgl1844(Cgl1919)
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CDI: DIP1413(sigB)
CDP: CD241_1358(sigB)
CDH: CDB402_1324(sigB)
CDT: CDHC01_1357(sigB)
CDE: CDHC02_1313(sigB)
CDR: CDHC03_1335(sigB)
CDA: CDHC04_1335(sigB)
CDZ: CD31A_1430(sigB)
CDB: CDBH8_1407(sigB)
CDS: CDC7B_1417(sigB)
CDD: CDCE8392_1331(sigB)
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CDIP: ERS451417_01435(sigB)
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CPP: CpP54B96_1236(sigB)
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CUS: CulFRC11_1299(sigB)
CUQ: Cul210931_1283(sigB)
CUZ: Cul05146_1357(sigB)
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CVA: CVAR_1587(sigB)
CTER: A606_06320
CGY: CGLY_07970(sigB)
COA: DR71_2091
CSX: CSING_07990(sigB)
CMQ: B840_07255(sigB)
CKU: UL82_06070(sigB)
CCJ: UL81_06870(sigB)
CMV: CMUST_08975(sigB)
CEI: CEPID_07325(sigB)
CTED: CTEST_07680(sigB)
CUT: CUTER_06420(sigB)
CDX: CDES_08570(sigB)
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CPHO: CPHO_05225
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CPEG: CPELA_04765(sigB)
CEE: CENDO_06575(sigB)
CGK: CGERO_06405(sigB)
CRL: NCTC7448_02070(sigB)
CCHO: CCHOA_06750(sigB)
CPRE: Csp1_12630(sigB)
NFA: NFA_37750(sigB)
NFR: ERS450000_00124(hrdB_1)
NCY: NOCYR_3677(sigB)
NNO: NONO_c53370(sigB)
NAD: NCTC11293_05146(hrdB_3)
RHA: RHA1_ro06813(sigB)
RER: RER_28040(sigB)
REY: O5Y_12905
ROP: ROP_67980(sigB)
REQ: REQ_20170(sigB)
RHB: NY08_1248
RFA: A3L23_04488(sigB)
RHS: A3Q41_03780(sigB)
RHU: A3Q40_01503(sigB)
RRT: 4535765_02057(hrdB)
RCR: NCTC10994_00807(hrdB)
GBR: Gbro_2238
GPO: GPOL_c21340(sigB)
GOR: KTR9_2152
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GOM: D7316_00758(sigB)
TPR: Tpau_1834
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SALL: SAZ_26230
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PFR: PFREUD_12070(hrdD1)
PFRE: RM25_0984
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NML: Namu_3785
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BSD: BLASA_3335(sigB)
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SACC: EYD13_13640(sigB)
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AMN: RAM_13050
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AMZ: B737_2541(rpoS)
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AJA: AJAP_26080(sigB)
AMQ: AMETH_4806(rpoS)
AMYY: YIM_14600(sigB)
AORI: SD37_13805
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PSEA: WY02_28055
PSEE: FRP1_14675
PSEH: XF36_14935
PAUT: Pdca_40990(rpoS)
AMI: Amir_1493
SESP: BN6_17770(sigB)
KAL: KALB_6862
ACTI: UA75_08325
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Reference
PMID:8475100
  Authors
Tanaka K, Takayanagi Y, Fujita N, Ishihama A, Takahashi H
  Title
Heterogeneity of the principal sigma factor in Escherichia coli: the rpoS gene product, sigma 38, is a second principal sigma factor of RNA polymerase in stationary-phase Escherichia coli.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 90:3511-5 (1993)
DOI:10.1073/pnas.90.8.3511
  Sequence
[eco:b2741]

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