#=GF ID CTU2
#=GF AC PF10288.15
#=GF DE Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2
#=GF PI DUF2392;
#=GF AU Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE Pfam-B_10085 (release 21.0)
#=GF GA 27.90 27.90;
#=GF TC 27.90 27.90;
#=GF NC 27.80 27.80;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 90746521 --cpu 8 -E 1000 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 18391219
#=GF RT The conserved Wobble uridine tRNA thiolase Ctu1-Ctu2 is required
#=GF RT to maintain genome integrity.
#=GF RA Dewez M, Bauer F, Dieu M, Raes M, Vandenhaute J, Hermand D;
#=GF RL Proc Natl Acad Sci U S A. 2008;105:5459-5464.
#=GF RN [2]
#=GF RM 18755837
#=GF RT A genome-wide screen identifies genes required for formation of
#=GF RT the wobble nucleoside 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine in
#=GF RT Saccharomyces cerevisiae.
#=GF RA Huang B, Lu J, Bystrom AS;
#=GF RL RNA. 2008;14:2183-2194.
#=GF RN [3]
#=GF RM 19151091
#=GF RT Mechanistic characterization of the sulfur-relay system for
#=GF RT eukaryotic 2-thiouridine biogenesis at tRNA wobble positions.
#=GF RA Noma A, Sakaguchi Y, Suzuki T;
#=GF RL Nucleic Acids Res. 2009;37:1335-1352.
#=GF DR INTERPRO; IPR019407;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC CTU2 is a family of proteins necessary for the formation of the
#=GF CC wobble nucleoside 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine in
#=GF CC Saccharomyces cerevisiae. The family is conserved from plants to
#=GF CC humans ]1]. It plays a central role in the 2-thiolation of
#=GF CC 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine, or the wobble nucleoside
#=GF CC [2]. This wobble modification in tRNAs,
#=GF CC 5-methoxycarbonylmethyl-2-thiouridine (mcm(5)s(2)U), is required
#=GF CC for the proper decoding of NNR codons in eukaryotes. The 2-thio
#=GF CC group gives rigidity by largely fixing the C3'-endo ribose
#=GF CC puckering, ensuring stable and accurate codon-anticodon pairing
#=GF CC [3].
#=GF SQ 2301
#=GS A0A7M5V777_9CNID/271-335 AC A0A7M5V777.1
#=GS A0A4U5VCA5_COLLU/323-467 AC A0A4U5VCA5.1
#=GS A0A9P8YFF6_9PEZI/387-520 AC A0A9P8YFF6.1
#=GS A0A814QS54_9BILA/272-358 AC A0A814QS54.1
#=GS A0AAD5FLA9_SILAS/307-443 AC A0AAD5FLA9.1
#=GS A0A164TSD3_9AGAM/312-405 AC A0A164TSD3.1
#=GS A0A834NNM7_VESGE/294-449 AC A0A834NNM7.1
#=GS A0A0J0XRY3_9TREE/297-385 AC A0A0J0XRY3.1
#=GS A0A5N5SQ18_9CRUS/333-448 AC A0A5N5SQ18.1
#=GS A0A1K0FVR1_9BASI/410-576 AC A0A1K0FVR1.1
#=GS A0A6P4ECP9_DRORH/295-394 AC A0A6P4ECP9.1
#=GS A0A395SDK3_9HYPO/650-713 AC A0A395SDK3.1
#=GS A0AAD5TCW5_9FUNG/267-354 AC A0AAD5TCW5.1
#=GS A0A0D9Y100_9ORYZ/279-400 AC A0A0D9Y100.1
#=GS A0A1V1TV78_9PEZI/370-473 AC A0A1V1TV78.1
#=GS A0A5N5NUE2_9PEZI/309-372 AC A0A5N5NUE2.1
#=GS A0A6J1DEW9_MOMCH/313-414 AC A0A6J1DEW9.1
#=GS A0A8C7FW63_ONCKI/339-465 AC A0A8C7FW63.1
#=GS A0A8C3K909_9CHAR/272-374 AC A0A8C3K909.1
#=GS A0A423X8W3_9PEZI/322-386 AC A0A423X8W3.1
#=GS A0A5N6IWL6_9EURO/288-346 AC A0A5N6IWL6.1
#=GS A0A9X0BDR0_9EURO/286-363 AC A0A9X0BDR0.1
#=GS A0A5C3F0T7_9BASI/382-455 AC A0A5C3F0T7.1
#=GS A0A7K7Q342_ACRAR/230-287 AC A0A7K7Q342.1
#=GS A0AAI8Z2B1_9PEZI/287-345 AC A0AAI8Z2B1.1
#=GS A0A8H8CW75_AJECA/282-368 AC A0A8H8CW75.1
#=GS A0A395NH80_TRIAR/282-363 AC A0A395NH80.1
#=GS A0A642UIU7_DIURU/299-405 AC A0A642UIU7.1
#=GS A0A0L7QXT9_9HYME/307-463 AC A0A0L7QXT9.1
#=GS A0A4E0REZ7_FASHE/270-382 AC A0A4E0REZ7.1
#=GS M3C4A8_SPHMS/287-346 AC M3C4A8.1
#=GS A0A2T3AWC7_AMORE/295-379 AC A0A2T3AWC7.1
#=GS A0A0W0EXU1_MONRR/336-424 AC A0A0W0EXU1.1
#=GS A0A367LI80_9HYPO/293-360 AC A0A367LI80.1
#=GS A0A2I0AFG1_9ASPA/302-411 AC A0A2I0AFG1.1
#=GS H3A073_LATCH/351-483 AC H3A073.1
#=GS A0A3N0XTG8_ANAGA/330-451 AC A0A3N0XTG8.1
#=GS A0A0C2X0K8_AMAMK/339-446 AC A0A0C2X0K8.1
#=GS A0A8T9BVX3_9HELO/292-376 AC A0A8T9BVX3.1
#=GS A0A8C1LA21_CYPCA/322-428 AC A0A8C1LA21.1
#=GS A0AA88DFL5_FICCA/322-425 AC A0AA88DFL5.1
#=GS A0AAY4DLK6_9TELE/311-378 AC A0AAY4DLK6.1
#=GS CTU2_ASPCL/288-345 AC A1CBI6.1
#=GS A0AAD4DLS3_9FUNG/344-480 AC A0AAD4DLS3.1
#=GS S8G345_TOXGM/551-669 AC S8G345.1
#=GS A0A484B3U2_DRONA/289-393 AC A0A484B3U2.1
#=GS A0A4U6XUR0_9PEZI/289-369 AC A0A4U6XUR0.1
#=GS A0A8C8C5T5_ONCTS/339-366 AC A0A8C8C5T5.2
#=GS A0A9P9TRE4_9HELO/294-378 AC A0A9P9TRE4.1
#=GS A0A8C5E2M1_GOUWI/320-411 AC A0A8C5E2M1.1
#=GS A0A7K6C1I0_PTIVI/385-442 AC A0A7K6C1I0.1
#=GS A0A5N5MU05_9PEZI/309-376 AC A0A5N5MU05.1
#=GS A0A9P1MDR3_9PEZI/276-351 AC A0A9P1MDR3.1
#=GS A0A1A6AAL2_9TREE/381-479 AC A0A1A6AAL2.1
#=GS A0A0C9LY09_DOTX1/309-402 AC A0A0C9LY09.1
#=GS A0A4V1M540_TREME/350-449 AC A0A4V1M540.1
#=GS A0A1I8MEV7_MUSDO/309-414 AC A0A1I8MEV7.1
#=GS A0A8J5ZPE0_GALPY/595-729 AC A0A8J5ZPE0.1
#=GS A0AA38PD10_9AGAR/335-427 AC A0AA38PD10.1
#=GS A0A8B8GAE5_9HEMI/285-401 AC A0A8B8GAE5.1
#=GS A0A7L1GJH5_9PICI/323-378 AC A0A7L1GJH5.1
#=GS A0A9P7F3W9_9AGAM/342-449 AC A0A9P7F3W9.1
#=GS A0A7K7AQD4_9AVES/322-380 AC A0A7K7AQD4.1
#=GS A0A250YJC2_CASCN/342-465 AC A0A250YJC2.1
#=GS A0A9P7XVK8_9FUNG/334-467 AC A0A9P7XVK8.1
#=GS A0AAD7E3X0_9AGAR/333-443 AC A0AAD7E3X0.1
#=GS A0AAE8SFN7_9HYPO/305-370 AC A0AAE8SFN7.1
#=GS A0A7K8JC22_9PASS/322-379 AC A0A7K8JC22.1
#=GS A0A8H7N348_BIOOC/304-369 AC A0A8H7N348.1
#=GS R0M3S7_ANAPL/50-146 AC R0M3S7.1
#=GS F0XUR0_GROCL/348-455 AC F0XUR0.1
#=GS M2NG02_BAUPA/292-360 AC M2NG02.1
#=GS A0AA40DD16_9PEZI/303-398 AC A0AA40DD16.1
#=GS A0A670YYR5_PSETE/351-435 AC A0A670YYR5.1
#=GS A0A162PGL9_9PEZI/649-730 AC A0A162PGL9.1
#=GS A0AAD7G114_9AGAR/335-424 AC A0AAD7G114.1
#=GS B3RVD1_TRIAD/309-417 AC B3RVD1.1
#=GS A0A087T0K5_STEMI/298-393 AC A0A087T0K5.1
#=GS A0A1V8UBZ5_9PEZI/300-366 AC A0A1V8UBZ5.1
#=GS A0A8T2J1K3_9PIPI/299-423 AC A0A8T2J1K3.1
#=GS A0A9P5TR56_GYMJU/337-451 AC A0A9P5TR56.1
#=GS A0A8C3A2E9_CYCLU/310-439 AC A0A8C3A2E9.1
#=GS A0A0C9TMY4_PAXIN/329-435 AC A0A0C9TMY4.1
#=GS A0A9W2XAP8_BETSP/324-460 AC A0A9W2XAP8.1
#=GS K3UJM5_FUSPC/306-369 AC K3UJM5.1
#=GS A0A3Q1FVH8_9TELE/324-463 AC A0A3Q1FVH8.1
#=GS G5C2U1_HETGA/348-473 AC G5C2U1.1
#=GS A0A2V1D7S5_9PLEO/287-341 AC A0A2V1D7S5.1
#=GS A0A4W5K7Q5_9TELE/339-477 AC A0A4W5K7Q5.1
#=GS A0A179IJZ4_CORDF/263-343 AC A0A179IJZ4.1
#=GS A0A0N0RTC7_9HYPO/333-421 AC A0A0N0RTC7.1
#=GS J4TSV8_SACK1/322-445 AC J4TSV8.1
#=GS A0A9P6FIB8_9FUNG/346-478 AC A0A9P6FIB8.1
#=GS A0A6P5KII9_PHACI/327-457 AC A0A6P5KII9.1
#=GS A0A8K0ULU1_9AGAR/344-434 AC A0A8K0ULU1.1
#=GS A0A2Y9DNL1_TRIMA/350-479 AC A0A2Y9DNL1.1
#=GS A0A7L4L9Q0_9CORV/325-438 AC A0A7L4L9Q0.1
#=GS A0A093XKF9_9PEZI/293-379 AC A0A093XKF9.1
#=GS A0A7E4V0E5_PANRE/275-352 AC A0A7E4V0E5.1
#=GS A0A667HME7_LYNCA/327-386 AC A0A667HME7.1
#=GS A0A8J2PDG8_9HEXA/352-446 AC A0A8J2PDG8.1
#=GS A0A090CXJ5_PODAN/307-399 AC A0A090CXJ5.1
#=GS A0A674IXU4_9SAUR/348-470 AC A0A674IXU4.1
#=GS N1S1G0_FUSC4/305-370 AC N1S1G0.1
#=GS A0A9W8LDA4_9FUNG/300-390 AC A0A9W8LDA4.1
#=GS A0A8H7ADU3_9EURO/282-343 AC A0A8H7ADU3.1
#=GS A0AAE0UED4_SORBR/346-455 AC A0AAE0UED4.1
#=GS A0A8H7Z2C5_9EURO/282-368 AC A0A8H7Z2C5.1
#=GS A0A6I8T636_AEDAE/295-437 AC A0A6I8T636.1
#=GS A0A6A6U242_9PEZI/277-357 AC A0A6A6U242.1
#=GS A0A7N8Y818_9TELE/290-371 AC A0A7N8Y818.1
#=GS A0A8C7FHL6_ONCKI/321-439 AC A0A8C7FHL6.1
#=GS A0A1V2L8J4_CYBFA/293-399 AC A0A1V2L8J4.1
#=GS A0A8S1BYY4_9INSE/289-387 AC A0A8S1BYY4.1
#=GS A0AAD8D460_ACIOX/335-465 AC A0AAD8D460.1
#=GS A0A672UC85_STRHB/346-448 AC A0A672UC85.1
#=GS A0A9P6IJU5_9FUNG/211-262 AC A0A9P6IJU5.1
#=GS A0A6A4HR43_9AGAR/323-410 AC A0A6A4HR43.1
#=GS A0A068V0C7_COFCA/330-464 AC A0A068V0C7.1
#=GS A0A852EEL1_VIDMA/393-445 AC A0A852EEL1.1
#=GS A0A9P5L7T7_PENCR/285-362 AC A0A9P5L7T7.1
#=GS A0A1B7TAX5_9ASCO/320-439 AC A0A1B7TAX5.1
#=GS A0A101MNB9_PENFR/299-369 AC A0A101MNB9.1
#=GS A0A9W8WWC3_9PLEO/288-341 AC A0A9W8WWC3.1
#=GS M4AJW1_XIPMA/323-451 AC M4AJW1.1
#=GS A0A6P7XYG4_9AMPH/334-463 AC A0A6P7XYG4.1
#=GS A0A852BZ27_9PICI/318-373 AC A0A852BZ27.1
#=GS A0A3Q7SXT1_VULVU/253-366 AC A0A3Q7SXT1.1
#=GS A0A8H6PWV1_9EURO/288-356 AC A0A8H6PWV1.1
#=GS A0A9Q1IHN9_SYNKA/353-431 AC A0A9Q1IHN9.1
#=GS A0AAZ3RJC7_ONCTS/339-483 AC A0AAZ3RJC7.1
#=GS A0A066VTG1_TILAU/541-716 AC A0A066VTG1.1
#=GS A0A7R8YTB6_HERIL/296-404 AC A0A7R8YTB6.1
#=GS A0A9W9H7A5_9EURO/289-359 AC A0A9W9H7A5.1
#=GS A0A367JVZ3_RHIST/129-239 AC A0A367JVZ3.1
#=GS A0A8B9NCI5_9AVES/294-394 AC A0A8B9NCI5.1
#=GS A0A8C8C7M2_ONCTS/341-483 AC A0A8C8C7M2.2
#=GS A0A9P5SYV2_9FUNG/354-482 AC A0A9P5SYV2.1
#=GS A0A8C6CU31_MOSMO/333-450 AC A0A8C6CU31.1
#=GS A0A3P9ADT2_ESOLU/348-492 AC A0A3P9ADT2.2
#=GS A0A3Q4HNW7_NEOBR/323-436 AC A0A3Q4HNW7.1
#=GS A0AA38R2F7_9PEZI/311-373 AC A0AA38R2F7.1
#=GS A0A9P5CTZ8_CRYP1/314-380 AC A0A9P5CTZ8.1
#=GS A0A1D2N3P7_ORCCI/349-411 AC A0A1D2N3P7.1
#=GS A0A9P4S5E4_9PEZI/321-447 AC A0A9P4S5E4.1
#=GS A0A3Q1M7F4_BOVIN/368-485 AC A0A3Q1M7F4.1
#=GS A0AAJ7IXF1_9HYME/296-432 AC A0AAJ7IXF1.1
#=GS A0A9P7GS04_9AGAR/366-499 AC A0A9P7GS04.1
#=GS A0A9P5CZ77_9EURO/244-327 AC A0A9P5CZ77.1
#=GS A0A3M7MR50_9EURO/787-846 AC A0A3M7MR50.1
#=GS A0A1S2XSY3_CICAR/298-396 AC A0A1S2XSY3.1
#=GS A0A8J2W8E8_9CRUS/295-428 AC A0A8J2W8E8.1
#=GS A0A151GHZ2_DRECN/297-364 AC A0A151GHZ2.1
#=GS F7B1B4_MONDO/362-493 AC F7B1B4.2
#=GS A0A5C3M6X1_9AGAR/361-475 AC A0A5C3M6X1.1
#=GS A0A8H7QS86_9FUNG/299-410 AC A0A8H7QS86.1
#=GS A0AAF0E4C8_9BASI/318-436 AC A0AAF0E4C8.1
#=GS A0AAD4GHE3_BOLED/340-445 AC A0AAD4GHE3.1
#=GS A0A8C7FGY2_ONCKI/341-445 AC A0A8C7FGY2.1
#=GS A0A6A6B610_9PEZI/284-337 AC A0A6A6B610.1
#=GS A0A8H5Z9S0_COCSA/318-372 AC A0A8H5Z9S0.1
#=GS A0A8D0AFP1_SANLU/323-466 AC A0A8D0AFP1.1
#=GS A0A7I8VW80_9ANNE/265-353 AC A0A7I8VW80.1
#=GS C5DSF1_ZYGRC/313-427 AC C5DSF1.1
#=GS A0A443S130_9ACAR/295-382 AC A0A443S130.1
#=GS S3CRK2_OPHP1/344-440 AC S3CRK2.1
#=GS A0A166Q0Q2_9PEZI/640-721 AC A0A166Q0Q2.1
#=GS A0A507AR44_9PEZI/650-732 AC A0A507AR44.1
#=GS A0A8H4A8S0_GIGMA/312-433 AC A0A8H4A8S0.1
#=GS A0A4Z2C6G1_9TELE/79-218 AC A0A4Z2C6G1.1
#=GS A0A8S1T2I5_PAROT/271-365 AC A0A8S1T2I5.1
#=GS S8B124_PENO1/282-352 AC S8B124.1
#=GS H2S4P2_TAKRU/329-468 AC H2S4P2.3
#=GS A0A8C2YHY8_CHILA/348-471 AC A0A8C2YHY8.1
#=GS G1XTP1_ARTOA/322-435 AC G1XTP1.1
#=GS A0A834ZDN2_TETSI/319-421 AC A0A834ZDN2.1
#=GS A0A6J0BPY2_NEOLC/293-429 AC A0A6J0BPY2.1
#=GS A0A4S8MW63_DENBC/339-426 AC A0A4S8MW63.1
#=GS A0A671LJ33_9TELE/330-457 AC A0A671LJ33.1
#=GS A0AAD7GY94_MYCRO/333-438 AC A0AAD7GY94.1
#=GS A0A7M4FV43_CROPO/593-712 AC A0A7M4FV43.1
#=GS A0A9P9IYT8_9PLEO/290-345 AC A0A9P9IYT8.1
#=GS A0A2J7RIJ4_9NEOP/219-379 AC A0A2J7RIJ4.1
#=GS W2SA74_CYPE1/289-350 AC W2SA74.1
#=GS B6K0A9_SCHJY/271-356 AC B6K0A9.1
#=GS A0AA38M7Z8_9CUCU/293-395 AC A0AA38M7Z8.1
#=GS A0A0C4E677_MAGP6/305-389 AC A0A0C4E677.1
#=GS A0A4Q4YF27_9PEZI/680-768 AC A0A4Q4YF27.1
#=GS A0A9W9N6N0_9EURO/285-355 AC A0A9W9N6N0.1
#=GS A0A0P7BH11_9HYPO/271-338 AC A0A0P7BH11.1
#=GS A0A8H5G6C8_9AGAR/331-435 AC A0A8H5G6C8.1
#=GS A0A7L2IDV2_9PICI/288-343 AC A0A7L2IDV2.1
#=GS A0A7K9JIH6_9PASE/290-351 AC A0A7K9JIH6.1
#=GS A0A9P3BNM5_ASPVI/288-355 AC A0A9P3BNM5.1
#=GS A0A1V8TT41_9PEZI/297-363 AC A0A1V8TT41.1
#=GS A0A8H4QNB3_9AGAR/346-460 AC A0A8H4QNB3.1
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